HOXA10

HOXA10
Ідентифікатори
Символи	HOXA10, HOX1, HOX1.8, HOX1H, PL, Homeobox A10
Зовнішні ІД	OMIM: 142957 MGI: 96171 HomoloGene: 7365 GeneCards: HOXA10
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • histone deacetylase binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • transcription regulator complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• skeletal system development; • proximal/distal pattern formation; • male gonad development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • single fertilization; • uterus development; • multicellular organism development; • embryonic limb morphogenesis; • Сперматогенез; • регуляція експресії генів; • anterior/posterior pattern specification; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3206
	15395
	ENSG00000253293
	ENSMUSG00000000938
	P31260
	P31310
	NM_018951; NM_153715
	NM_001122950; NM_008263
	NP_061824
	NP_001116422; NP_032289
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXA10 (англ. Homeobox A10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 410 амінокислот, а молекулярна маса — 42 414^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSARKGYLLP	SPNYPTTMSC	SESPAANSFL	VDSLISSGRG	EAGGGGGGAG
GGGGGGYYAH	GGVYLPPAAD	LPYGLQSCGL	FPTLGGKRNE	AASPGSGGGG
GGLGPGAHGY	GPSPIDLWLD	APRSCRMEPP	DGPPPPPQQQ	PPPPPQPPQP
APQATSCSFA	QNIKEESSYC	LYDSADKCPK	VSATAAELAP	FPRGPPPDGC
ALGTSSGVPV	PGYFRLSQAY	GTAKGYGSGG	GGAQQLGAGP	FPAQPPGRGF
DLPPALASGS	ADAARKERAL	DSPPPPTLAC	GSGGGSQGDE	EAHASSSAAE
ELSPAPSESS	KASPEKDSLG	NSKGENAANW	LTAKSGRKKR	CPYTKHQTLE
LEKEFLFNMY	LTRERRLEIS	RSVHLTDRQV	KIWFQNRRMK	LKKMNRENRI
RELTANFNFS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Castronovo V., Kusaka M., Chariot A., Gielen J., Sobel M. (1994). Homeobox genes: potential candidates for the transcriptional control of the transformed and invasive phenotype. Biochem. Pharmacol. 47: 137—143. PMID 7906121 doi:10.1016/0006-2952(94)90447-2
Bae N.S., Swanson M.J., Vassilev A., Howard B.H. (2004). Human histone deacetylase SIRT2 interacts with the homeobox transcription factor HOXA10. J. Biochem. 135: 695—700. PMID 15213244 doi:10.1093/jb/mvh084

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5100 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P31260 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5100 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P31260 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]