ZNF318 (англ. Zinc finger protein 318) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 279 амінокислот, а молекулярна маса — 251 112[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MYRSSARSSV
|
|
SSHRPKDDGG
|
|
GGPRSGRSSG
|
|
SSSGPARRSS
|
|
PPPPPSGSSS
|
| RTPARRPRSP
|
|
SGHRGRRASP
|
|
SPPRGRRVSP
|
|
SPPRARRGSP
|
|
SPPRGRRLFP
|
| PGPAGFRGSS
|
|
RGESRADYAR
|
|
DGRGDHPGDS
|
|
GSRRRSPGLC
|
|
SDSLEKSLRI
|
| TVGNDHFCVS
|
|
TPERRRLSDR
|
|
LGSPVDNLED
|
|
MDRDDLTDDS
|
|
VFTRSSQCSR
|
| GLERYISQEE
|
|
GPLSPFLGQL
|
|
DEDYRTKETF
|
|
LHRSDYSPHI
|
|
SCHDELLRGT
|
| ERNREKLKGY
|
|
SIRSEERSRE
|
|
AKRPRYDDTV
|
|
KINSMGGDHP
|
|
SFTSGTRNYR
|
| QRRRSPSPRF
|
|
LDPEFRELDL
|
|
ARRKREEEEE
|
|
RSRSLSQELV
|
|
GVDGGGTGCS
|
| IPGLSGVLTA
|
|
SEPGYSLHRP
|
|
EEVSVMPKKS
|
|
ILKKRIEVDI
|
|
MEPSMQLESF
|
| SSSTSSSQDH
|
|
PLYSGHPSLP
|
|
LSGAIAAFAS
|
|
EIENKGTMVE
|
|
TALKEPQGNL
|
| YQWGPLPGIP
|
|
KDNSPLREKF
|
|
GSFLCHKDNL
|
|
DLKAEGPERH
|
|
TDFLLPHERA
|
| SQDGSGFSRI
|
|
LSMLADSTST
|
|
QEKRRRSFPD
|
|
IEDEEKFLYG
|
|
DEEEDLKAES
|
| VPKPLGSSES
|
|
EVMRQKASSL
|
|
PSSAPAVKLE
|
|
SLEETNPEYA
|
|
KIHDLLKTIG
|
| LDIGVAEISQ
|
|
LAARTQERLH
|
|
GKKPSLRSSA
|
|
DRRSSVDRYF
|
|
SADHCSSVDH
|
| RFSADRCSSV
|
|
DHCFSADRRS
|
|
SDPHRLESRE
|
|
AHHSNTHSPE
|
|
VSHPHPPSPV
|
| DPYLLTKNSP
|
|
PFLKSDHPVG
|
|
HISGPEVVGS
|
|
GFQSSVAVRC
|
|
MLPSAPSAPI
|
| RLPHTAALSQ
|
|
FHMPRASQFA
|
|
AARIPPNYQG
|
|
PAIPPASFDA
|
|
YRHYMAYAAS
|
| RWPMYPTSQP
|
|
SNHPVPEPHR
|
|
IMPITKQATR
|
|
SRPNLRVIPT
|
|
VTPDKPKQKE
|
| SLRGSIPAAQ
|
|
VPVQVSIPSL
|
|
IRYNPEKISD
|
|
EKNRASQKQK
|
|
VIEEREKLKN
|
| DREARQKKMY
|
|
YLRTELERLH
|
|
KQQGEMLRKK
|
|
RREKDGHKDP
|
|
LLVEVSRLQD
|
| NIMKDIAELR
|
|
QEAEEAEKKQ
|
|
SELDKVAQIL
|
|
GINIFDKSQK
|
|
SLSDSREPTE
|
| KPGKAEKSKS
|
|
PEKVSSFSNS
|
|
SSNKESKVNN
|
|
EKFRTKSPKP
|
|
AESPQSATKQ
|
| LDQPTAAYEY
|
|
YDAGNHWCKD
|
|
CNTICGTMFD
|
|
FFTHMHNKKH
|
|
TQTLDPYNRP
|
| WASKTQSEAK
|
|
QDAIKRTDKI
|
|
TVPAKGSEFL
|
|
VPISGFYCQL
|
|
CEEFLGDPIS
|
| GEQHVKGHQH
|
|
NEKYKKYVDE
|
|
NPLYEERRNL
|
|
DRQAGLAVVL
|
|
ETERRRQSEL
|
| KRKLSEKPKE
|
|
EKKEKKAKAV
|
|
KEVKEDDKVS
|
|
EKLEDQLSEG
|
|
RNSPEKAENK
|
| RNTGIKLQLK
|
|
EEVKKESPTS
|
|
SSFGKFSWKK
|
|
PEKEEEKSSL
|
|
VTPSISKEEI
|
| LESSKDKEDG
|
|
KTEAGKAKPI
|
|
KIKLSGKTVV
|
|
AHTSPWMPVV
|
|
TTSTQTKIRP
|
| NLPIPSTVLR
|
|
KSCSATMSKP
|
|
APLNTFLSIK
|
|
SSGTTAKPLP
|
|
VVKESSADLL
|
| LPPDIISKAF
|
|
GGEEVILKGS
|
|
PEEKVVLAEK
|
|
SEPSHLPEQI
|
|
LPPPPPPPPP
|
| PPPPPPVIPH
|
|
PAAPSAAQAN
|
|
AILAPVKSNP
|
|
VVSQTLSPGF
|
|
VGPNILNPVL
|
| PVAIMASAQP
|
|
AAIPSDETAP
|
|
GVSESDRDQT
|
|
LFSVLVRPPP
|
|
PLSSVFSEQA
|
| KKLEKRNSCL
|
|
ATANAKDLYD
|
|
IFYSSGGKGA
|
|
PETKGAPETK
|
|
LSGGPLANGE
|
| NSNLSRTKSS
|
|
DTSSTSPLNS
|
|
SASQEELHQD
|
|
EGLVAAPIVS
|
|
NSEKPIAKTL
|
| VALGKWSVVE
|
|
HVGPKSTGST
|
|
YGFLQPLTRL
|
|
CQSRPYETIT
|
|
PKTDTLAIWT
|
| SSSFQSDTSR
|
|
DISPEKSELD
|
|
LGEPGPPGVE
|
|
PPPQLLDIQC
|
|
KESQKLVEIH
|
| LRESVNQDKE
|
|
SQELRKSEDC
|
|
RESEIETNTE
|
|
LKERVKELSE
|
|
GIVDEGVSTS
|
| IGPHSIDDSN
|
|
LNHGNRYMWE
|
|
GEVKQPNLLM
|
|
IDKEAEQSNK
|
|
LMTGSETPSK
|
| VVIKLSPQAC
|
|
SFTKAKLDSF
|
|
LSEARSLLNP
|
|
QDTPVKISAP
|
|
ELLLHSPARS
|
| AMCLTGSPQE
|
|
QGVSVVSEEG
|
|
LENSAPESAS
|
|
RTSRYRSLKL
|
|
KRERSKDFQV
|
| KKIYELAVWD
|
|
ENKKRPETWE
|
|
SPEKPKTEAL
|
|
ELQDVHPELT
|
|
VTIESKALED
|
| FEATDLKVEE
|
|
LTALGNLGDM
|
|
PVDFCTTRVS
|
|
PAHRSPTVLC
|
|
QKVCEENSVS
|
| PIGCNSSDPA
|
|
DFEPIPSFSG
|
|
FPLDSPKTLV
|
|
LDFETEGERN
|
|
SPNPRSVRIP
|
| SPNILKTGLT
|
|
ENVDRGLGGL
|
|
EGTHQALDLL
|
|
AGGMMPEEVK
|
|
ESSQLDKQES
|
| LGLELKTINS
|
|
AGLGPSPCLP
|
|
DLVDFVTRTS
|
|
GVQKDKLCSP
|
|
LSEPGDPSKC
|
| SSLELGPLQL
|
|
EISNASTTEV
|
|
AILQVDDDSG
|
|
DPLNLVKAPV
|
|
SRSPPREQVI
|
| EDNMVPQGMP
|
|
EQETTVGAIQ
|
|
DHTESSVHN
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, мейоз, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|