| IRF4
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| IRF4, LSIRF, MUM1, NF-EM5, SHEP8, interferon regulatory factor 4 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601900 MGI: 1096873 HomoloGene: 1842 GeneCards: IRF4
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| хронічний лімфолейкоз, skin carcinoma, прогресуючий супрануклеарний параліч[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • protein-lysine N-methyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• гіалоплазма • мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • interferon-gamma-mediated signaling pathway • regulation of T-helper cell differentiation • myeloid dendritic cell differentiation • transcription, DNA-templated • T-helper 17 cell lineage commitment • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • peptidyl-lysine methylation • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway • type I interferon signaling pathway • histone H3 acetylation • histone H4 acetylation • positive regulation of DNA binding • T cell activation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • defense response to protozoan • Метилювання білків • transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • positive regulation of cold-induced thermogenesis • процес імунної системи
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 6: 0.39 – 0.41 Mb
| Хр. 13: 30.93 – 30.95 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
IRF4 (англ. Interferon regulatory factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 51 772[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MNLEGGGRGG
|
|
EFGMSAVSCG
|
|
NGKLRQWLID
|
|
QIDSGKYPGL
|
|
VWENEEKSIF
|
| RIPWKHAGKQ
|
|
DYNREEDAAL
|
|
FKAWALFKGK
|
|
FREGIDKPDP
|
|
PTWKTRLRCA
|
| LNKSNDFEEL
|
|
VERSQLDISD
|
|
PYKVYRIVPE
|
|
GAKKGAKQLT
|
|
LEDPQMSMSH
|
| PYTMTTPYPS
|
|
LPAQQVHNYM
|
|
MPPLDRSWRD
|
|
YVPDQPHPEI
|
|
PYQCPMTFGP
|
| RGHHWQGPAC
|
|
ENGCQVTGTF
|
|
YACAPPESQA
|
|
PGVPTEPSIR
|
|
SAEALAFSDC
|
| RLHICLYYRE
|
|
ILVKELTTSS
|
|
PEGCRISHGH
|
|
TYDASNLDQV
|
|
LFPYPEDNGQ
|
| RKNIEKLLSH
|
|
LERGVVLWMA
|
|
PDGLYAKRLC
|
|
QSRIYWDGPL
|
|
ALCNDRPNKL
|
| ERDQTCKLFD
|
|
TQQFLSELQA
|
|
FAHHGRSLPR
|
|
FQVTLCFGEE
|
|
FPDPQRQRKL
|
| ITAHVEPLLA
|
|
RQLYYFAQQN
|
|
SGHFLRGYDL
|
|
PEHISNPEDY
|
|
HRSIRHSSIQ
|
| E
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|