ATF2

ATF2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BHI, 1T2K, 4H36
Ідентифікатори
Символи	ATF2, CRE-BP1, CREB-2, CREB2, HB16, TREB7, activating transcription factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 123811 MGI: 109349 HomoloGene: 31061 GeneCards: ATF2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • cAMP response element binding protein binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • chromatin binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • nucleic acid binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • protein kinase binding; • cAMP response element binding; • histone acetyltransferase activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor binding; • protein heterodimerization activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • нуклеоплазма; • мітохондріальна зовнішня мембрана; • мітохондрія; • клітинне ядро; • site of double-strand break;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling; • outflow tract morphogenesis; • response to water deprivation; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of transforming growth factor beta2 production; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • response to osmotic stress; • positive regulation of neuron apoptotic process; • regulation of DNA-binding transcription factor activity; • positive regulation of mitochondrial membrane permeability involved in apoptotic process; • negative regulation of epithelial cell proliferation; • adipose tissue development; • fat cell differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • amelogenesis; • histone acetylation; • positive regulation of cardiac muscle myoblast proliferation; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • negative regulation of angiogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1386
	11909
	ENSG00000115966
	ENSMUSG00000027104
	P15336
	P16951
NM_001256090; NM_001256091; NM_001256092; NM_001256093; NM_001256094;
	NM_001880
NM_001025093; NM_001284369; NM_001284370; NM_001284371; NM_001284372;
	NM_001284373; NM_001284374; NM_001284376; NM_009715
NP_001243019; NP_001243020; NP_001243021; NP_001243022; NP_001243023;
	NP_001871
NP_001020264; NP_001271298; NP_001271299; NP_001271300; NP_001271301;
	NP_001271302; NP_001271303; NP_001271305; NP_033845
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ATF2 (англ. Activating transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 505 амінокислот, а молекулярна маса — 54 537^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKFKLHVNSA	RQYKDLWNMS	DDKPFLCTAP	GCGQRFTNED	HLAVHKHKHE
MTLKFGPARN	DSVIVADQTP	TPTRFLKNCE	EVGLFNELAS	PFENEFKKAS
EDDIKKMPLD	LSPLATPIIR	SKIEEPSVVE	TTHQDSPLPH	PESTTSDEKE
VPLAQTAQPT	SAIVRPASLQ	VPNVLLTSSD	SSVIIQQAVP	SPTSSTVITQ
APSSNRPIVP	VPGPFPLLLH	LPNGQTMPVA	IPASITSSNV	HVPAAVPLVR
PVTMVPSVPG	IPGPSSPQPV	QSEAKMRLKA	ALTQQHPPVT	NGDTVKGHGS
GLVRTQSEES	RPQSLQQPAT	STTETPASPA	HTTPQTQSTS	GRRRRAANED
PDEKRRKFLE	RNRAAASRCR	QKRKVWVQSL	EKKAEDLSSL	NGQLQSEVTL
LRNEVAQLKQ	LLLAHKDCPV	TAMQKKSGYH	TADKDDSSED	ISVPSSPHTE
AIQHSSVSTS	NGVSSTSKAE	AVATSVLTQM	ADQSTEPALS	QIVMAPSSQS
QPSGS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Kara C.J., Liou H.-C., Ivashkiv L.B., Glimcher L.H. (1990). A cDNA for a human cyclic AMP response element-binding protein which is distinct from CREB and expressed preferentially in brain. Mol. Cell. Biol. 10: 1347—1357. PMID 2320002 doi:10.1128/MCB.10.4.1347
Enslen H., Tokumitsu H., Stork P.J., Davis R.J., Soderling T.R. (1996). Regulation of mitogen-activated protein kinases by a calcium/calmodulin-dependent protein kinase cascade. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 10803—10808. PMID 8855261 doi:10.1073/pnas.93.20.10803
Enslen H., Raingeaud J., Davis R.J. (1998). Selective activation of p38 mitogen-activated protein (MAP) kinase isoforms by the MAP kinase kinases MKK3 and MKK6. J. Biol. Chem. 273: 1741—1748. PMID 9430721 doi:10.1074/jbc.273.3.1741
Sevilla A., Santos C.R., Vega F.M., Lazo P.A. (2004). Human vaccinia-related kinase 1 (VRK1) activates the ATF2 transcriptional activity by novel phosphorylation on Thr-73 and Ser-62 and cooperates with JNK. J. Biol. Chem. 279: 27458—27465. PMID 15105425 doi:10.1074/jbc.M401009200
Bhoumik A., Ronai Z. (2008). ATF2: a transcription factor that elicits oncogenic or tumor suppressor activities. Cell Cycle. 7: 2341—2345. PMID 18677098 doi:10.4161/cc.6388

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:784 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-25 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P15336 (англ.) . Архів оригіналу за 29 червня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:784 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-25 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P15336 (англ.) . Архів оригіналу за 29 червня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]