JARID2

JARID2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5HYN
Ідентифікатори
Символи	JARID2, JMJ, jumonji and AT-rich interaction domain containing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 601594 MGI: 104813 HomoloGene: 31279 GeneCards: JARID2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • chromatin binding; • histone demethylase activity; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • methylated histone binding; • histone H3-tri/di/monomethyl-lysine-4 demethylase activity;
Клітинна компонента	• ESC/E(Z) complex; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • histone methyltransferase complex; • мітохондрія;
Біологічний процес	• диференціація клітин; • negative regulation of histone methylation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • thymus development; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • spleen development; • transcription, DNA-templated; • stem cell differentiation; • multicellular organism development; • central nervous system development; • negative regulation of gene expression, epigenetic; • regulation of cell population proliferation; • liver development; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of cell population proliferation; • positive regulation of histone H3-K9 methylation; • negative regulation of cardiac muscle hypertrophy; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • negative regulation of cardiac muscle cell proliferation; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • histone demethylation; • ремоделювання хроматину; • histone H3-K4 demethylation, trimethyl-H3-K4-specific;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3720
	16468
	ENSG00000008083
	ENSMUSG00000038518
	Q92833
	Q62315
	NM_001267040; NM_004973
	NM_001205043; NM_001205044; NM_021878; NM_001360281
	NP_001253969; NP_004964
	NP_001191972; NP_001191973; NP_068678; NP_001347210
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

JARID2 (англ. Jumonji and AT-rich interaction domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 246 амінокислот, а молекулярна маса — 138 734^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSKERPKRNI	IQKKYDDSDG	IPWSEERVVR	KVLYLSLKEF	KNSQKRQHAE
GIAGSLKTVN	GLLGNDQSKG	LGPASEQSEN	EKDDASQVSS	TSNDVSSSDF
EEGPSRKRPR	LQAQRKFAQS	QPNSPSTTPV	KIVEPLLPPP	ATQISDLSKR
KPKTEDFLTF	LCLRGSPALP	NSMVYFGSSQ	DEEEVEEEDD	ETEDVKTATN
NASSSCQSTP	RKGKTHKHVH	NGHVFNGSSR	STREKEPVQK	HKSKEATPAK
EKHSDHRADS	RREQASANHP	AAAPSTGSSA	KGLAATHHHP	PLHRSAQDLR
KQVSKVNGVT	RMSSLGAGVT	SAKKMREVRP	SPSKTVKYTA	TVTKGAVTYT
KAKRELVKDT	KPNHHKPSSA	VNHTISGKTE	SSNAKTRKQV	LSLGGASKST
GPAVNGLKVS	GRLNPKSCTK	EVGGRQLREG	LQLREGLRNS	KRRLEEAHQA
EKPQSPPKKM	KGAAGPAEGP	GKKAPAERGL	LNGHVKKEVP	ERSLERNRPK
RATAGKSTPG	RQAHGKADSA	SCENRSTSQP	ESVHKPQDSG	KAEKGGGKAG
WAAMDEIPVL	RPSAKEFHDP	LIYIESVRAQ	VEKFGMCRVI	PPPDWRPECK
LNDEMRFVTQ	IQHIHKLGRR	WGPNVQRLAC	IKKHLKSQGI	TMDELPLIGG
CELDLACFFR	LINEMGGMQQ	VTDLKKWNKL	ADMLRIPRTA	QDRLAKLQEA
YCQYLLSYDS	LSPEEHRRLE	KEVLMEKEIL	EKRKGPLEGH	TENDHHKFHP
LPRFEPKNGL	IHGVAPRNGF	RSKLKEVGQA	QLKTGRRRLF	AQEKEVVKEE
EEDKGVLNDF	HKCIYKGRSV	SLTTFYRTAR	NIMSMCFSKE	PAPAEIEQEY
WRLVEEKDCH	VAVHCGKVDT	NTHGSGFPVG	KSEPFSRHGW	NLTVLPNNTG
SILRHLGAVP	GVTIPWLNIG	MVFSTSCWSR	DQNHLPYIDY	LHTGADCIWY
CIPAEEENKL	EDVVHTLLQA	NGTPGLQMLE	SNVMISPEVL	CKEGIKVHRT
VQQSGQFVVC	FPGSFVSKVC	CGYSVSETVH	FATTQWTSMG	FETAKEMKRR
HIAKPFSMEK	LLYQIAQAEA	KKENGPTLST	ISALLDELRD	TELRQRRQLF
EAGLHSSARY	GSHDGSSTVA	DGKKKPRKWL	QLETSERRCQ	ICQHLCYLSM
VVQENENVVF	CLECALRHVE	KQKSCRGLKL	MYRYDEEQII	SLVNQICGKV
SGKNGSIENC	LSKPTPKRGP	RKRATVDVPP	SRLSASSSSK	SASSSS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6196 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q92833 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6196 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q92833 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]