ZEB2

ZEB2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DA7
Ідентифікатори
Символи	ZEB2, HSPC082, SIP-1, SIP1, SMADIP1, ZFHX1B, zinc finger E-box binding homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605802 MGI: 1344407 HomoloGene: 8868 GeneCards: ZEB2
Пов'язані генетичні захворювання
	шизофренія, Рак нирки, Mowat-Wilson syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • phosphatase regulator activity; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • R-SMAD binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • ядерце; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • нейробіологія розвитку; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of melanin biosynthetic process; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • neural crest cell migration; • somitogenesis; • neural tube closure; • transcription by RNA polymerase II; • central nervous system development; • corpus callosum morphogenesis; • hippocampus development; • cell proliferation in forebrain; • corticospinal tract morphogenesis; • positive regulation of Wnt signaling pathway; • positive regulation of JUN kinase activity; • positive regulation of melanocyte differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • developmental pigmentation; • embryonic morphogenesis; • collateral sprouting; • positive regulation of axonogenesis; • mammillary axonal complex development; • melanocyte migration; • positive regulation of lens fiber cell differentiation; • regulation of melanosome organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9839
	24136
	ENSG00000169554
	ENSMUSG00000026872
	O60315
	Q9R0G7
	NM_001171653; NM_014795
NM_015753; NM_001289521; NM_001355288; NM_001355289; NM_001355290;
	NM_001355291
	NP_001165124; NP_055610
NP_001276450; NP_056568; NP_001342217; NP_001342218; NP_001342219;
	NP_001342220
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZEB2 (англ. Zinc finger E-box binding homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 214 амінокислот, а молекулярна маса — 136 447^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKQPIMADGP	RCKRRKQANP	RRKNVVNYDN	VVDTGSETDE	EDKLHIAEDD
GIANPLDQET	SPASVPNHES	SPHVSQALLP	REEEEDEIRE	GGVEHPWHNN
EILQASVDGP	EEMKEDYDTM	GPEATIQTAI	NNGTVKNANC	TSDFEEYFAK
RKLEERDGHA	VSIEEYLQRS	DTAIIYPEAP	EELSRLGTPE	ANGQEENDLP
PGTPDAFAQL	LTCPYCDRGY	KRLTSLKEHI	KYRHEKNEEN	FSCPLCSYTF
AYRTQLERHM	VTHKPGTDQH	QMLTQGAGNR	KFKCTECGKA	FKYKHHLKEH
LRIHSGEKPY	ECPNCKKRFS	HSGSYSSHIS	SKKCIGLISV	NGRMRNNIKT
GSSPNSVSSS	PTNSAITQLR	NKLENGKPLS	MSEQTGLLKI	KTEPLDFNDY
KVLMATHGFS	GTSPFMNGGL	GATSPLGVHP	SAQSPMQHLG	VGMEAPLLGF
PTMNSNLSEV	QKVLQIVDNT	VSRQKMDCKA	EEISKLKGYH	MKDPCSQPEE
QGVTSPNIPP	VGLPVVSHNG	ATKSIIDYTL	EKVNEAKACL	QSLTTDSRRQ
ISNIKKEKLR	TLIDLVTDDK	MIENHNISTP	FSCQFCKESF	PGPIPLHQHE
RYLCKMNEEI	KAVLQPHENI	VPNKAGVFVD	NKALLLSSVL	SEKGMTSPIN
PYKDHMSVLK	AYYAMNMEPN	SDELLKISIA	VGLPQEFVKE	WFEQRKVYQY
SNSRSPSLER	SSKPLAPNSN	PPTKDSLLPR	SPVKPMDSIT	SPSIAELHNS
VTNCDPPLRL	TKPSHFTNIK	PVEKLDHSRS	NTPSPLNLSS	TSSKNSHSSS
YTPNSFSSEE	LQAEPLDLSL	PKQMKEPKSI	IATKNKTKAS	SISLDHNSVS
SSSENSDEPL	NLTFIKKEFS	NSNNLDNKST	NPVFSMNPFS	AKPLYTALPP
QSAFPPATFM	PPVQTSIPGL	RPYPGLDQMS	FLPHMAYTYP	TGAATFADMQ
QRRKYQRKQG	FQGELLDGAQ	DYMSGLDDMT	DSDSCLSRKK	IKKTESGMYA
CDLCDKTFQK	SSSLLRHKYE	HTGKRPHQCQ	ICKKAFKHKH	HLIEHSRLHS
GEKPYQCDKC	GKRFSHSGSY	SQHMNHRYSY	CKREAEEREA	AEREAREKGH
LEPTELLMNR	AYLQSITPQG	YSDSEERESM	PRDGESEKEH	EKEGEDGYGK
LGRQDGDEEF	EEEEEESENK	SMDTDPETIR	DEEETGDHSM	DDSSEDGKME
TKSDHEEDNM	EDGM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Long J., Zuo D., Park M. (2005). Pc2-mediated sumoylation of Smad-interacting protein 1 attenuates transcriptional repression of E-cadherin. J. Biol. Chem. 280: 35477—35489. PMID 16061479 doi:10.1074/jbc.M504477200
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ZEB2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14881 (англ.) . Архів оригіналу за 6 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2016-11-06 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O60315 (англ.) . Архів оригіналу за 13 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ZEB2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14881 (англ.) . Архів оригіналу за 6 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2016-11-06 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, O60315 (англ.) . Архів оригіналу за 13 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]