| ATOH1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ATOH1, ATH1, HATH1, MATH-1, bHLHa14, atonal bHLH transcription factor 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601461 MGI: 104654 HomoloGene: 31297 GeneCards: ATOH1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• Сигнальний шлях Notch • regulation of neuron differentiation • auditory receptor cell fate determination • диференціація клітин • positive regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of inner ear receptor cell differentiation • negative regulation of apoptotic process • neuron migration • auditory receptor cell fate specification • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • axon guidance • multicellular organism development • central nervous system development • brain development • inner ear auditory receptor cell differentiation • inner ear morphogenesis • positive regulation of neuron differentiation • neuron differentiation • cerebral cortex development • inner ear development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 4: 93.83 – 93.83 Mb
| Хр. 6: 64.71 – 64.71 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
ATOH1 (англ. Atonal bHLH transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 354 амінокислот, а молекулярна маса — 38 160[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSRLLHAEEW
|
|
AEVKELGDHH
|
|
RQPQPHHLPQ
|
|
PPPPPQPPAT
|
|
LQAREHPVYP
|
| PELSLLDSTD
|
|
PRAWLAPTLQ
|
|
GICTARAAQY
|
|
LLHSPELGAS
|
|
EAAAPRDEVD
|
| GRGELVRRSS
|
|
GGASSSKSPG
|
|
PVKVREQLCK
|
|
LKGGVVVDEL
|
|
GCSRQRAPSS
|
| KQVNGVQKQR
|
|
RLAANARERR
|
|
RMHGLNHAFD
|
|
QLRNVIPSFN
|
|
NDKKLSKYET
|
| LQMAQIYINA
|
|
LSELLQTPSG
|
|
GEQPPPPPAS
|
|
CKSDHHHLRT
|
|
AASYEGGAGN
|
| ATAAGAQQAS
|
|
GGSQRPTPPG
|
|
SCRTRFSAPA
|
|
SAGGYSVQLD
|
|
ALHFSTFEDS
|
| ALTAMMAQKN
|
|
LSPSLPGSIL
|
|
QPVQEENSKT
|
|
SPRSHRSDGE
|
|
FSPHSHYSDS
|
| DEAS
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, нейрогенез, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|