| NR1H2
|
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
| Список кодів PDB |
|
1P8D, 1PQ6, 1PQ9, 1PQC, 1UPV, 1UPW, 3KFC, 3L0E, 4DK7, 4DK8, 4RAK, 5HJP, 4NQA, 5I4V,%%s4NQA
| | |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| NR1H2, LXR-b, LXRB, NER, NER-I, RIP15, UNR, Liver X receptor beta, nuclear receptor subfamily 1 group H member 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600380 MGI: 1352463 HomoloGene: 21397 GeneCards: NR1H2
|
|---|
|
|
| Реагує на сполуку |
|---|
| (25R)-cholest-5-ene-3β,26-diol, desmosterol[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • ATPase binding • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування з іоном металу • retinoid X receptor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • steroid hormone receptor activity • apolipoprotein A-I receptor binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • RNA polymerase II transcription regulator complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• positive regulation of high-density lipoprotein particle assembly • negative regulation of proteolysis • positive regulation of triglyceride biosynthetic process • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process • negative regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of cholesterol transport • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular lipid metabolic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of secretion of lysosomal enzymes • positive regulation of lipid storage • positive regulation of lipoprotein lipase activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of fatty acid biosynthetic process • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • negative regulation of cholesterol storage • negative regulation of pinocytosis • GO:1901313 positive regulation of gene expression • retinoic acid receptor signaling pathway • positive regulation of cholesterol efflux • positive regulation of pancreatic juice secretion • lipid homeostasis • negative regulation of lipid transport • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • steroid hormone mediated signaling pathway • cholesterol homeostasis • Обмін жирів • multicellular organism development • диференціація клітин • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of cold-induced thermogenesis • intracellular receptor signaling pathway
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 19: 50.33 – 50.38 Mb
| Хр. 7: 44.2 – 44.2 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
NR1H2 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group H member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 460 амінокислот, а молекулярна маса — 50 974[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSSPTTSSLD
|
|
TPLPGNGPPQ
|
|
PGAPSSSPTV
|
|
KEEGPEPWPG
|
|
GPDPDVPGTD
|
| EASSACSTDW
|
|
VIPDPEEEPE
|
|
RKRKKGPAPK
|
|
MLGHELCRVC
|
|
GDKASGFHYN
|
| VLSCEGCKGF
|
|
FRRSVVRGGA
|
|
RRYACRGGGT
|
|
CQMDAFMRRK
|
|
CQQCRLRKCK
|
| EAGMREQCVL
|
|
SEEQIRKKKI
|
|
RKQQQESQSQ
|
|
SQSPVGPQGS
|
|
SSSASGPGAS
|
| PGGSEAGSQG
|
|
SGEGEGVQLT
|
|
AAQELMIQQL
|
|
VAAQLQCNKR
|
|
SFSDQPKVTP
|
| WPLGADPQSR
|
|
DARQQRFAHF
|
|
TELAIISVQE
|
|
IVDFAKQVPG
|
|
FLQLGREDQI
|
| ALLKASTIEI
|
|
MLLETARRYN
|
|
HETECITFLK
|
|
DFTYSKDDFH
|
|
RAGLQVEFIN
|
| PIFEFSRAMR
|
|
RLGLDDAEYA
|
|
LLIAINIFSA
|
|
DRPNVQEPGR
|
|
VEALQQPYVE
|
| ALLSYTRIKR
|
|
PQDQLRFPRM
|
|
LMKLVSLRTL
|
|
SSVHSEQVFA
|
|
LRLQDKKLPP
|
| LLSEIWDVHE
|
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|