HOXB6

HOXB6
Ідентифікатори
Символи	HOXB6, HOX2, HOX2B, HU-2, Hox-2.2, homeobox B6
Зовнішні ІД	OMIM: 142961 MGI: 96187 HomoloGene: 7366 GeneCards: HOXB6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• embryonic skeletal system morphogenesis; • multicellular organism development; • erythrocyte homeostasis; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • anterior/posterior pattern specification; • embryonic skeletal system development; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3216
	15414
	ENSG00000108511
	ENSMUSG00000000690
	P17509
	P09023
	NM_018952; NM_156036; NM_156037; NM_001369397
	NM_008269
	NP_061825; NP_001356326
	NP_032295
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXB6 (англ. Homeobox B6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот, а молекулярна маса — 25 432^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSYFVNSTF	PVTLASGQES	FLGQLPLYSS	GYADPLRHYP	APYGPGPGQD
KGFATSSYYP	PAGGGYGRAA	PCDYGPAPAF	YREKESACAL	SGADEQPPFH
PEPRKSDCAQ	DKSVFGETEE	QKCSTPVYPW	MQRMNSCNSS	SFGPSGRRGR
QTYTRYQTLE	LEKEFHYNRY	LTRRRRIEIA	HALCLTERQI	KIWFQNRRMK
WKKESKLLSA	SQLSAEEEEE	KQAE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Shen W.-F., Detmer K., Simonitch-Eason T.A., Lawrence H.J., Largman C. (1991). Alternative splicing of the HOX 2.2 homeobox gene in human hematopoietic cells and murine embryonic and adult tissues. Nucleic Acids Res. 19: 539—545. PMID 1672751 doi:10.1093/nar/19.3.539
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Levine M., Rubin G.M., Tjian R. (1984). Human DNA sequences homologous to a protein coding region conserved between homeotic genes of Drosophila. Cell. 38: 667—673. PMID 6091895 doi:10.1016/0092-8674(84)90261-7

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5117 (англ.) . Архів оригіналу за 3 липня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-07-03 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P17509 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5117 (англ.) . Архів оригіналу за 3 липня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-07-03 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P17509 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]