JADE3 (англ. Jade family PHD finger 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 823 амінокислот, а молекулярна маса — 93 808[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MKRHRPVSSS
|
|
DSSDESPSTS
|
|
FTSGSMYRIK
|
|
SKIPNEHKKP
|
|
AEVFRKDLIS
|
| AMKLPDSHHI
|
|
NPDSYYLFAD
|
|
TWKEEWEKGV
|
|
QVPASPDTVP
|
|
QPSLRIIAEK
|
| VKDVLFIRPR
|
|
KYIHCSSPDT
|
|
TEPGYINIME
|
|
LAASVCRYDL
|
|
DDMDIFWLQE
|
| LNEDLAEMGC
|
|
GPVDENLMEK
|
|
TVEVLERHCH
|
|
ENMNHAIETE
|
|
EGLGIEYDED
|
| VICDVCRSPD
|
|
SEEGNDMVFC
|
|
DKCNVCVHQA
|
|
CYGILKVPEG
|
|
SWLCRSCVLG
|
| IYPQCVLCPK
|
|
KGGALKTTKT
|
|
GTKWAHVSCA
|
|
LWIPEVSIAC
|
|
PERMEPITKI
|
| SHIPPSRWAL
|
|
VCNLCKLKTG
|
|
ACIQCSIKSC
|
|
ITAFHVTCAF
|
|
EHGLEMKTIL
|
| DEGDEVKFKS
|
|
YCLKHSQNRQ
|
|
KLGEAEYPHH
|
|
RAKEQSQAKS
|
|
EKTSLRAQKL
|
| RELEEEFYSL
|
|
VRVEDVAAEL
|
|
GMPTLAVDFI
|
|
YNYWKLKRKS
|
|
NFNKPLFPPK
|
| EDEENGLVQP
|
|
KEESIHTRMR
|
|
MFMHLRQDLE
|
|
RVRNLCYMIS
|
|
RREKLKLSHN
|
| KIQEQIFGLQ
|
|
VQLLNQEIDA
|
|
GLPLTNALEN
|
|
SLFYPPPRIT
|
|
LKLKMPKSTP
|
| EDHRNSSTET
|
|
DQQPHSPDSS
|
|
SSVHSIRNMQ
|
|
VPQESLEMRT
|
|
KSYPRYPLES
|
| KNNRLLASLS
|
|
HSRSEAKESS
|
|
PAWRTPSSEC
|
|
YHGQSLGKPL
|
|
VLQAALHGQS
|
| SIGNGKSQPN
|
|
SKFAKSNGLE
|
|
GSWSGNVTQK
|
|
DSSSEMFCDQ
|
|
EPVFSPHLVS
|
| QGSFRKSTVE
|
|
HFSRSFKETT
|
|
NRWVKNTEDL
|
|
QCYVKPTKNM
|
|
SPKEQFWGRQ
|
| VLRRSAGRAP
|
|
YQENDGYCPD
|
|
LELSDSEAES
|
|
DGNKEKVRVR
|
|
KDSSDRENPP
|
| HDSRRDCHGK
|
|
SKTHPLSHSS
|
|
MQR
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Tzouanacou E., Tweedie S., Wilson V. (2003). Identification of Jade1, a gene encoding a PHD zinc finger protein, in a gene trap mutagenesis screen for genes involved in anteroposterior axis development. Mol. Cell. Biol. 23: 8553—8562. PMID 14612400 doi:10.1128/MCB.23.23.8553-8562.2003
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|