| FOXE1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| FOXE1, FKHL15, FOXE2, HFKH4, HFKL5, TITF2, TTF-2, TTF2, NMTC4, forkhead box E1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602617 MGI: 1353500 HomoloGene: 3291 GeneCards: FOXE1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Bamforth-Lazarus syndrome[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • soft palate development • hair follicle morphogenesis • thyroid hormone generation • thyroid gland development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • pharynx development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cell migration • embryonic organ morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • hard palate development • transcription, DNA-templated • thymus development • roof of mouth development • cranial skeletal system development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 9: 97.85 – 97.86 Mb
| н/д
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
FOXE1 (англ. Forkhead box E1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 373 амінокислот, а молекулярна маса — 38 076[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MTAESGPPPP
|
|
QPEVLATVKE
|
|
ERGETAAGAG
|
|
VPGEATGRGA
|
|
GGRRRKRPLQ
|
| RGKPPYSYIA
|
|
LIAMAIAHAP
|
|
ERRLTLGGIY
|
|
KFITERFPFY
|
|
RDNPKKWQNS
|
| IRHNLTLNDC
|
|
FLKIPREAGR
|
|
PGKGNYWALD
|
|
PNAEDMFESG
|
|
SFLRRRKRFK
|
| RSDLSTYPAY
|
|
MHDAAAAAAA
|
|
AAAAAAAAAI
|
|
FPGAVPAARP
|
|
PYPGAVYAGY
|
| APPSLAAPPP
|
|
VYYPAASPGP
|
|
CRVFGLVPER
|
|
PLSPELGPAP
|
|
SGPGGSCAFA
|
| SAGAPATTTG
|
|
YQPAGCTGAR
|
|
PANPSAYAAA
|
|
YAGPDGAYPQ
|
|
GAGSAIFAAA
|
| GRLAGPASPP
|
|
AGGSSGGVET
|
|
TVDFYGRTSP
|
|
GQFGALGACY
|
|
NPGGQLGGAS
|
| AGAYHARHAA
|
|
AYPGGIDRFV
|
|
SAM
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Chadwick B.P., Obermayr F., Frischauf A.-M. (1997). FKHL15, a new human member of the forkhead gene family located on chromosome 9q22. Genomics. 41: 390—396. PMID 9169137 doi:10.1006/geno.1997.4692
- Macchia P.E., Mattei M.-G., Lapi P., Fenzi G., Di Lauro R. (1999). Cloning, chromosomal localization and identification of polymorphisms in the human thyroid transcription factor 2 gene (TITF2). Biochimie. 81: 433—440. PMID 10403172 doi:10.1016/S0300-9084(99)80092-3
- Kang I.N., Musa M., Harun F., Junit S.M. (2010). Characterization of mutations in the FOXE1 gene in a cohort of unrelated Malaysian patients with congenital hypothyroidism and thyroid dysgenesis. Biochem. Genet. 48: 141—151. PMID 20094846 doi:10.1007/s10528-009-9306-7
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|