| FOXL2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| FOXL2, BPES, BPES1, PFRK, PINTO, POF3, forkhead box L2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 605597 MGI: 1349428 HomoloGene: 74992 GeneCards: FOXL2
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| передчасне виснаження яєчників, blepharophimosis, ptosis, and epicanthus inversus syndrome[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • cysteine-type endopeptidase regulator activity involved in apoptotic process • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • estrogen receptor binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • intercellular bridge • нуклеоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• oocyte growth • apoptotic DNA fragmentation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • extraocular skeletal muscle development • embryonic eye morphogenesis • positive regulation of follicle-stimulating hormone secretion • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • female gonad development • single fertilization • uterus development • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • positive regulation of apoptotic process • ovarian follicle development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • female somatic sex determination • granulosa cell differentiation • positive regulation of luteinizing hormone secretion • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 3: 138.94 – 138.95 Mb
| Хр. 9: 98.84 – 98.84 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
FOXL2 (англ. Forkhead box L2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 376 амінокислот, а молекулярна маса — 38 772[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MMASYPEPED
|
|
AAGALLAPET
|
|
GRTVKEPEGP
|
|
PPSPGKGGGG
|
|
GGGTAPEKPD
|
| PAQKPPYSYV
|
|
ALIAMAIRES
|
|
AEKRLTLSGI
|
|
YQYIIAKFPF
|
|
YEKNKKGWQN
|
| SIRHNLSLNE
|
|
CFIKVPREGG
|
|
GERKGNYWTL
|
|
DPACEDMFEK
|
|
GNYRRRRRMK
|
| RPFRPPPAHF
|
|
QPGKGLFGAG
|
|
GAAGGCGVAG
|
|
AGADGYGYLA
|
|
PPKYLQSGFL
|
| NNSWPLPQPP
|
|
SPMPYASCQM
|
|
AAAAAAAAAA
|
|
AAAAGPGSPG
|
|
AAAVVKGLAG
|
| PAASYGPYTR
|
|
VQSMALPPGV
|
|
VNSYNGLGGP
|
|
PAAPPPPPHP
|
|
HPHPHAHHLH
|
| AAAAPPPAPP
|
|
HHGAAAPPPG
|
|
QLSPASPATA
|
|
APPAPAPTSA
|
|
PGLQFACARQ
|
| PELAMMHCSY
|
|
WDHDSKTGAL
|
|
HSRLDL
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Kuo F.T., Bentsi-Barnes I.K., Barlow G.M., Bae J., Pisarska M.D. (2009). Sumoylation of forkhead L2 by Ubc9 is required for its activity as a transcriptional repressor of the steroidogenic acute regulatory gene. Cell. Signal. 21: 1935—1944. PMID 19744555 doi:10.1016/j.cellsig.2009.09.001
- Beysen D., Vandesompele J., Messiaen L., De Paepe A., De Baere E. (2004). The human FOXL2 mutation database. Hum. Mutat. 24: 189—193. PMID 15300845 doi:10.1002/humu.20079
- Kumar A., Babu M., Raghunath A., Venkatesh C.P. (2004). Genetic analysis of a five generation Indian family with BPES: a novel missense mutation (p.Y215C). Mol. Vis. 10: 445—449. PMID 15257268
- Or S.F., Tong M.F., Lo F.M., Lam T.S. (2006). Three novel FOXL2 gene mutations in Chinese patients with blepharophimosis-ptosis-epicanthus inversus syndrome. Chin. Med. J. 119: 49—52. PMID 16454982
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|