| SP7
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| SP7, OI11, OI12, OSX, osterix, Sp7 transcription factor |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 606633 MGI: 2153568 HomoloGene: 15607 GeneCards: SP7
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| osteogenesis imperfecta type 12[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• nucleic acid binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • DEAD/H-box RNA helicase binding • зв’язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • цитоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • hematopoietic stem cell differentiation • positive regulation of stem cell differentiation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 12: 53.33 – 53.35 Mb
| Хр. 15: 102.27 – 102.28 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
SP7 (англ. Sp7 transcription factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот, а молекулярна маса — 44 718[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MASSLLEEEA
|
|
HYGSSPLAML
|
|
TAACSKFGGS
|
|
SPLRDSTTLG
|
|
KGGTKKPYAD
|
| LSAPKTMGDA
|
|
YPAPFSSTNG
|
|
LLSPAGSPPA
|
|
PASGYANDYP
|
|
PFPHSFPGPT
|
| GAQDPGLLVP
|
|
KGHSSSDCLP
|
|
SVYTSLDMTH
|
|
PYGSWYKAGI
|
|
HAGISPGPGN
|
| TPTPWWDMHP
|
|
GGNWLGGGQG
|
|
QGDGLQGTLS
|
|
TGPAQPPLNP
|
|
QLPTYPSDFA
|
| PLNPAPYPAP
|
|
HLLQPGPQHV
|
|
LPQDVYKPKA
|
|
VGNSGQLEGS
|
|
GAAKPPRGAG
|
| TGGSGGYAGS
|
|
GAGRSTCDCP
|
|
NCQELERLGA
|
|
AAAGLRKKPI
|
|
HSCHIPGCGK
|
| VYGKASHLKA
|
|
HLRWHTGERP
|
|
FVCNWLFCGK
|
|
RFTRSDELER
|
|
HVRTHTREKK
|
| FTCLLCSKRF
|
|
TRSDHLSKHQ
|
|
RTHGEPGPGP
|
|
PPSGPKELGE
|
|
GRSVGEEEAN
|
| QPPRSSTSPA
|
|
PPEKAHGGSP
|
|
EQSNLLEI
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Sinha K.M., Yasuda H., Coombes M.M., Dent S.Y., de Crombrugghe B. (2010). Regulation of the osteoblast-specific transcription factor Osterix by NO66, a Jumonji family histone demethylase. EMBO J. 29: 68—79. PMID 19927124 doi:10.1038/emboj.2009.332
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|