| GABPA
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| GABPA, E4TF1-60, E4TF1A, NFT2, NRF2, NRF2A, RCH04A07, GA binding protein transcription factor alpha subunit, GA binding protein transcription factor subunit alpha |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600609 MGI: 95610 HomoloGene: 1543 GeneCards: GABPA
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • mitochondrion organization • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of megakaryocyte differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:1901313 positive regulation of gene expression • cellular response to dopamine • blastocyst formation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 21: 25.73 – 25.77 Mb
| Хр. 16: 84.63 – 84.66 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
GABPA (англ. GA binding protein transcription factor alpha subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 51 295[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MTKREAEELI
|
|
EIEIDGTEKA
|
|
ECTEESIVEQ
|
|
TYAPAECVSQ
|
|
AIDINEPIGN
|
| LKKLLEPRLQ
|
|
CSLDAHEICL
|
|
QDIQLDPERS
|
|
LFDQGVKTDG
|
|
TVQLSVQVIS
|
| YQGIEPKLNI
|
|
LEIVKPADTV
|
|
EVVIDPDAHH
|
|
AESEAHLVEE
|
|
AQVITLDGTK
|
| HITTISDETS
|
|
EQVTRWAAAL
|
|
EGYRKEQERL
|
|
GIPYDPIQWS
|
|
TDQVLHWVVW
|
| VMKEFSMTDI
|
|
DLTTLNISGR
|
|
ELCSLNQEDF
|
|
FQRVPRGEIL
|
|
WSHLELLRKY
|
| VLASQEQQMN
|
|
EIVTIDQPVQ
|
|
IIPASVQSAT
|
|
PTTIKVINSS
|
|
AKAAKVQRAP
|
| RISGEDRSSP
|
|
GNRTGNNGQI
|
|
QLWQFLLELL
|
|
TDKDARDCIS
|
|
WVGDEGEFKL
|
| NQPELVAQKW
|
|
GQRKNKPTMN
|
|
YEKLSRALRY
|
|
YYDGDMICKV
|
|
QGKRFVYKFV
|
| CDLKTLIGYS
|
|
AAELNRLVTE
|
|
CEQKKLAKMQ
|
|
LHGIAQPVTA
|
|
VALATASLQT
|
| EKDN
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|