| ERF
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ERF, CRS4, PE-2, PE2, ETS2 repressor factor, CHYTS |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 611888 MGI: 109637 HomoloGene: 68516 GeneCards: ERF
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| isolated scaphocephaly[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0007067 мітоз • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 19: 42.25 – 42.26 Mb
| Хр. 7: 25.24 – 25.25 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
ERF (англ. ETS2 repressor factor) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 548 амінокислот, а молекулярна маса — 58 703[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MKTPADTGFA
|
|
FPDWAYKPES
|
|
SPGSRQIQLW
|
|
HFILELLRKE
|
|
EYQGVIAWQG
|
| DYGEFVIKDP
|
|
DEVARLWGVR
|
|
KCKPQMNYDK
|
|
LSRALRYYYN
|
|
KRILHKTKGK
|
| RFTYKFNFNK
|
|
LVLVNYPFID
|
|
VGLAGGAVPQ
|
|
SAPPVPSGGS
|
|
HFRFPPSTPS
|
| EVLSPTEDPR
|
|
SPPACSSSSS
|
|
SLFSAVVARR
|
|
LGRGSVSDCS
|
|
DGTSELEEPL
|
| GEDPRARPPG
|
|
PPDLGAFRGP
|
|
PLARLPHDPG
|
|
VFRVYPRPRG
|
|
GPEPLSPFPV
|
| SPLAGPGSLL
|
|
PPQLSPALPM
|
|
TPTHLAYTPS
|
|
PTLSPMYPSG
|
|
GGGPSGSGGG
|
| SHFSFSPEDM
|
|
KRYLQAHTQS
|
|
VYNYHLSPRA
|
|
FLHYPGLVVP
|
|
QPQRPDKCPL
|
| PPMAPETPPV
|
|
PSSASSSSSS
|
|
SSSPFKFKLQ
|
|
PPPLGRRQRA
|
|
AGEKAVAGAD
|
| KSGGSAGGLA
|
|
EGAGALAPPP
|
|
PPPQIKVEPI
|
|
SEGESEEVEV
|
|
TDISDEDEED
|
| GEVFKTPRAP
|
|
PAPPKPEPGE
|
|
APGASQCMPL
|
|
KLRFKRRWSE
|
|
DCRLEGGGGP
|
| AGGFEDEGED
|
|
KKVRGEGPGE
|
|
AGGPLTPRRV
|
|
SSDLQHATAQ
|
|
LSLEHRDS
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|