| ETS1
|
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
| Список кодів PDB |
|
1GVJ, 2NNY, 2STT, 2STW, 3MFK, 3RI4, 3WTS, 3WTT, 3WTU, 3WTV, 3WTW, 3WTX, 3WTY, 3WTZ, 3WU0, 3WU1, 4L0Y, 4L0Z, 4L18, 4LG0
| | |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ETS1, ETS-1, EWSR2, p54, c-ets-1, ETS proto-oncogene 1, transcription factor |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 164720 MGI: 95455 HomoloGene: 3837 GeneCards: ETS1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| ожиріння, целіакія, системний червоний вовчак[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific double-stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • histone acetyltransferase binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• regulation of apoptotic process • pituitary gland development • response to estradiol • response to interleukin-1 • response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of erythrocyte differentiation • cell motility • еструс • процес імунної системи • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1904576 response to antibiotic • жіноча вагітність • angiogenesis involved in wound healing • positive regulation of cell migration • response to mechanical stimulus • response to laminar fluid shear stress • negative regulation of cell cycle • regulation of angiogenesis • transcription by RNA polymerase II • regulation of extracellular matrix disassembly • transcription, DNA-templated • positive regulation of endothelial cell migration • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • PML body organization • response to wounding • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of cell population proliferation • hypothalamus development • negative regulation of inflammatory response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to hydrogen peroxide • positive regulation of inflammatory response • pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration • positive regulation of angiogenesis • диференціація клітин
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 11: 128.46 – 128.59 Mb
| Хр. 9: 32.64 – 32.76 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
ETS1 (англ. ETS proto-oncogene 1, transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 50 408[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MKAAVDLKPT
|
|
LTIIKTEKVD
|
|
LELFPSPDME
|
|
CADVPLLTPS
|
|
SKEMMSQALK
|
| ATFSGFTKEQ
|
|
QRLGIPKDPR
|
|
QWTETHVRDW
|
|
VMWAVNEFSL
|
|
KGVDFQKFCM
|
| NGAALCALGK
|
|
DCFLELAPDF
|
|
VGDILWEHLE
|
|
ILQKEDVKPY
|
|
QVNGVNPAYP
|
| ESRYTSDYFI
|
|
SYGIEHAQCV
|
|
PPSEFSEPSF
|
|
ITESYQTLHP
|
|
ISSEELLSLK
|
| YENDYPSVIL
|
|
RDPLQTDTLQ
|
|
NDYFAIKQEV
|
|
VTPDNMCMGR
|
|
TSRGKLGGQD
|
| SFESIESYDS
|
|
CDRLTQSWSS
|
|
QSSFNSLQRV
|
|
PSYDSFDSED
|
|
YPAALPNHKP
|
| KGTFKDYVRD
|
|
RADLNKDKPV
|
|
IPAAALAGYT
|
|
GSGPIQLWQF
|
|
LLELLTDKSC
|
| QSFISWTGDG
|
|
WEFKLSDPDE
|
|
VARRWGKRKN
|
|
KPKMNYEKLS
|
|
RGLRYYYDKN
|
| IIHKTAGKRY
|
|
VYRFVCDLQS
|
|
LLGYTPEELH
|
|
AMLDVKPDAD
|
|
E
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Majerus M.-A., Bibollet-Ruche F., Telliez J.-B., Wasylyk B., Bailleul B. (1992). Serum, AP-1 and Ets-1 stimulate the human ets-1 promoter. Nucleic Acids Res. 20: 2699—2703. PMID 1614856 doi:10.1093/nar/20.11.2699
- Hahn S.L., Criqui-Filipe P., Wasylyk B. (1997). Modulation of ETS-1 transcriptional activity by huUBC9, a ubiquitin-conjugating enzyme. Oncogene. 15: 1489—1495. PMID 9333025 doi:10.1038/sj.onc.1201301
- Li R., Pei H., Watson D.K., Papas T.S. (2000). EAP1/Daxx interacts with ETS1 and represses transcriptional activation of ETS1 target genes. Oncogene. 19: 745—753. PMID 10698492 doi:10.1038/sj.onc.1203385
- Wasylyk C., Schlumberger S.E., Criqui-Filipe P., Wasylyk B. (2002). Sp100 interacts with ETS-1 and stimulates its transcriptional activity. Mol. Cell. Biol. 22: 2687—2702. PMID 11909962 doi:10.1128/MCB.22.8.2687-2702.2002
- Russell L., Garrett-Sinha L.A. (2010). Transcription factor Ets-1 in cytokine and chemokine gene regulation. Cytokine. 51: 217—226. PMID 20378371 doi:10.1016/j.cyto.2010.03.006
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|