| ZNF165
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ZNF165, CT53, LD65, ZSCAN7, zinc finger protein 165 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600834 HomoloGene: 122143 GeneCards: ZNF165
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 6: 28.08 – 28.09 Mb
| н/д
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| н/д |
|---|
| Вікідані |
|
ZNF165 (англ. Zinc finger protein 165) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 485 амінокислот, а молекулярна маса — 55 771[3].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MATEPKKAAA
|
|
QNSPEDEGLL
|
|
IVKIEEEEFI
|
|
HGQDTCLQRS
|
|
ELLKQELCRQ
|
| LFRQFCYQDS
|
|
PGPREALSRL
|
|
RELCCQWLKP
|
|
EIHTKEQILE
|
|
LLVLEQFLTI
|
| LPGDLQAWVH
|
|
EHYPESGEEA
|
|
VTILEDLERG
|
|
TDEAVLQVQA
|
|
HEHGQEIFQK
|
| KVSPPGPALN
|
|
VKLQPVETKA
|
|
HFDSSEPQLL
|
|
WDCDNESENS
|
|
RSMPKLEIFE
|
| KIESQRIISG
|
|
RISGYISEAS
|
|
GESQDICKSA
|
|
GRVKRQWEKE
|
|
SGESQRLSSA
|
| QDEGFGKILT
|
|
HKNTVRGEII
|
|
SHDGCERRLN
|
|
LNSNEFTHQK
|
|
SCKHGTCDQS
|
| FKWNSDFINH
|
|
QIIYAGEKNH
|
|
QYGKSFKSPK
|
|
LAKHAAVFSG
|
|
DKTHQCNECG
|
| KAFRHSSKLA
|
|
RHQRIHTGER
|
|
CYECNECGKS
|
|
FAESSDLTRH
|
|
RRIHTGERPF
|
| GCKECGRAFN
|
|
LNSHLIRHQR
|
|
IHTREKPYEC
|
|
SECGKTFRVS
|
|
SHLIRHFRIH
|
| TGEKPYECSE
|
|
CGRAFSQSSN
|
|
LSQHQRIHMR
|
|
ENLLM
|
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Tirosvoutis K.N., Divane A., Jones M., Affara N.A. (1995). Characterization of a novel zinc finger gene (ZNF165) mapping to 6p21 that is expressed specifically in testis. Genomics. 28: 485—490. PMID 7490084 doi:10.1006/geno.1995.1178
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|