HMGN1

HMGN1
Ідентифікатори
Символи	HMGN1, HMG14, high mobility group nucleosome binding domain 1
Зовнішні ІД	OMIM: 163920 HomoloGene: 3643 GeneCards: HMGN1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleosomal DNA binding; • DNA binding; • chromatin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • хроматин; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• positive regulation of DNA-templated transcription, elongation; • pyrimidine dimer repair by nucleotide-excision repair; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • response to UV-B; • response to UV-C; • regulation of development, heterochronic; • post-embryonic camera-type eye morphogenesis; • regulation of epithelial cell proliferation; • positive regulation of NAD+ ADP-ribosyltransferase activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3150
	100911295
	ENSG00000205581
	н/д
	P05114
	Q5U1W8
	NM_004965
	XM_003751029
	NP_004956
	NP_001013202
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HMGN1 (англ. High mobility group nucleosome binding domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 100 амінокислот, а молекулярна маса — 10 659^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPKRKVSSAE	GAAKEEPKRR	SARLSAKPPA	KVEAKPKKAA	AKDKSSDKKV
QTKGKRGAKG	KQAEVANQET	KEDLPAENGE	TKTEESPASD	EAGEKEAKSD

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

G: Гліцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Louie D.F., Gloor K.K., Galasinski S.C., Resing K.A., Ahn N.G. (2000). Phosphorylation and subcellular redistribution of high mobility group proteins 14 and 17, analyzed by mass spectrometry. Protein Sci. 9: 170—179. PMID 10739259 doi:10.1110/ps.9.1.170
Zougman A., Ziolkowski P., Mann M., Wisniewski J.R. (2008). Evidence for insertional RNA editing in humans. Curr. Biol. 18: 1760—1765. PMID 18993075 doi:10.1016/j.cub.2008.09.059
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 doi:10.1021/pr800500r
Landsman D., Srikantha T., Westermann R., Bustin M. (1986). Chromosomal protein HMG-14. Complete human cDNA sequence and evidence for a multigene family. J. Biol. Chem. 261: 16082—16086. PMID 3782107

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4984 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P05114 (англ.) . Архів оригіналу за 15 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4984 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P05114 (англ.) . Архів оригіналу за 15 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]