| SALL2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| SALL2, COLB, HSAL2, Sal-2, ZNF795, p150(Sal2), spalt-like transcription factor 2, spalt like transcription factor 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602219 MGI: 1354373 HomoloGene: 9269 GeneCards: SALL2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• NuRD complex • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• розвиток ока • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • neural tube development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 14: 21.52 – 21.54 Mb
| Хр. 14: 52.55 – 52.57 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
SALL2 (англ. Spalt like transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 007 амінокислот, а молекулярна маса — 105 309[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSRRKQRKPQ
|
|
QLISDCEGPS
|
|
ASENGDASEE
|
|
DHPQVCAKCC
|
|
AQFTDPTEFL
|
| AHQNACSTDP
|
|
PVMVIIGGQE
|
|
NPNNSSASSE
|
|
PRPEGHNNPQ
|
|
VMDTEHSNPP
|
| DSGSSVPTDP
|
|
TWGPERRGEE
|
|
SPGHFLVAAT
|
|
GTAAGGGGGL
|
|
ILASPKLGAT
|
| PLPPESTPAP
|
|
PPPPPPPPPP
|
|
GVGSGHLNIP
|
|
LILEELRVLQ
|
|
QRQIHQMQMT
|
| EQICRQVLLL
|
|
GSLGQTVGAP
|
|
ASPSELPGTG
|
|
TASSTKPLLP
|
|
LFSPIKPVQT
|
| SKTLASSSSS
|
|
SSSSSGAETP
|
|
KQAFFHLYHP
|
|
LGSQHPFSAG
|
|
GVGRSHKPTP
|
| APSPALPGST
|
|
DQLIASPHLA
|
|
FPSTTGLLAA
|
|
QCLGAARGLE
|
|
ATASPGLLKP
|
| KNGSGELSYG
|
|
EVMGPLEKPG
|
|
GRHKCRFCAK
|
|
VFGSDSALQI
|
|
HLRSHTGERP
|
| YKCNVCGNRF
|
|
TTRGNLKVHF
|
|
HRHREKYPHV
|
|
QMNPHPVPEH
|
|
LDYVITSSGL
|
| PYGMSVPPEK
|
|
AEEEAATPGG
|
|
GVERKPLVAS
|
|
TTALSATESL
|
|
TLLSTSAGTA
|
| TAPGLPAFNK
|
|
FVLMKAVEPK
|
|
NKADENTPPG
|
|
SEGSAISGVA
|
|
ESSTATRMQL
|
| SKLVTSLPSW
|
|
ALLTNHFKST
|
|
GSFPFPYVLE
|
|
PLGASPSETS
|
|
KLQQLVEKID
|
| RQGAVAVTSA
|
|
ASGAPTTSAP
|
|
APSSSASSGP
|
|
NQCVICLRVL
|
|
SCPRALRLHY
|
| GQHGGERPFK
|
|
CKVCGRAFST
|
|
RGNLRAHFVG
|
|
HKASPAARAQ
|
|
NSCPICQKKF
|
| TNAVTLQQHV
|
|
RMHLGGQIPN
|
|
GGTALPEGGG
|
|
AAQENGSEQS
|
|
TVSGAGSFPQ
|
| QQSQQPSPEE
|
|
ELSEEEEEED
|
|
EEEEEDVTDE
|
|
DSLAGRGSES
|
|
GGEKAISVRG
|
| DSEEASGAEE
|
|
EVGTVAAAAT
|
|
AGKEMDSNEK
|
|
TTQQSSLPPP
|
|
PPPDSLDQPQ
|
| PMEQGSSGVL
|
|
GGKEEGGKPE
|
|
RSSSPASALT
|
|
PEGEATSVTL
|
|
VEELSLQEAM
|
| RKEPGESSSR
|
|
KACEVCGQAF
|
|
PSQAALEEHQ
|
|
KTHPKEGPLF
|
|
TCVFCRQGFL
|
| ERATLKKHML
|
|
LAHHQVQPFA
|
|
PHGPQNIAAL
|
|
SLVPGCSPSI
|
|
TSTGLSPFPR
|
| KDDPTIP
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|