| GTF2H4
|
|---|
|
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| GTF2H4, general transcription factor IIH, polypeptide 4, 52kDa, P52, TFB2, TFIIH, general transcription factor IIH subunit 4 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601760 MGI: 1338799 HomoloGene: 7090 GeneCards: GTF2H4
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• protein kinase activity • ATP-dependent activity, acting on DNA • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0004003 DNA helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity • зв’язування дволанцюгових ДНК • ATPase activator activity • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • transcription factor TFIIH holo complex • core TFIIH complex portion of holo TFIIH complex • GO:0000441 transcription factor TFIIH core complex • клітинне ядро • transcription factor TFIID complex • nuclear speck
|
|---|
| Біологічний процес |
• termination of RNA polymerase I transcription • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • global genome nucleotide-excision repair • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • nucleotide-excision repair, DNA incision • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • DNA duplex unwinding • positive regulation of ATP-dependent activity • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 6: 30.91 – 30.91 Mb
| Хр. 17: 35.98 – 35.98 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
GTF2H4 (англ. General transcription factor IIH subunit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 462 амінокислот, а молекулярна маса — 52 186[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MESTPSRGLN
|
|
RVHLQCRNLQ
|
|
EFLGGLSPGV
|
|
LDRLYGHPAT
|
|
CLAVFRELPS
|
| LAKNWVMRML
|
|
FLEQPLPQAA
|
|
VALWVKKEFS
|
|
KAQEESTGLL
|
|
SGLRIWHTQL
|
| LPGGLQGLIL
|
|
NPIFRQNLRI
|
|
ALLGGGKAWS
|
|
DDTSQLGPDK
|
|
HARDVPSLDK
|
| YAEERWEVVL
|
|
HFMVGSPSAA
|
|
VSQDLAQLLS
|
|
QAGLMKSTEP
|
|
GEPPCITSAG
|
| FQFLLLDTPA
|
|
QLWYFMLQYL
|
|
QTAQSRGMDL
|
|
VEILSFLFQL
|
|
SFSTLGKDYS
|
| VEGMSDSLLN
|
|
FLQHLREFGL
|
|
VFQRKRKSRR
|
|
YYPTRLAINL
|
|
SSGVSGAGGT
|
| VHQPGFIVVE
|
|
TNYRLYAYTE
|
|
SELQIALIAL
|
|
FSEMLYRFPN
|
|
MVVAQVTRES
|
| VQQAIASGIT
|
|
AQQIIHFLRT
|
|
RAHPVMLKQT
|
|
PVLPPTITDQ
|
|
IRLWELERDR
|
| LRFTEGVLYN
|
|
QFLSQVDFEL
|
|
LLAHARELGV
|
|
LVFENSAKRL
|
|
MVVTPAGHSD
|
| VKRFWKRQKH
|
|
SS
|
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|