SMAD2

SMAD2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1DEV, 1KHX, 1U7V, 2LB3
Ідентифікатори
Символи	SMAD2, JV18, JV18-1, MADH2, MADR2, hMAD-2, hSMAD family member 2, LDS6, CHTD8
Зовнішні ІД	OMIM: 601366 MGI: 108051 HomoloGene: 21197 GeneCards: SMAD2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatase binding; • I-SMAD binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • R-SMAD binding; • co-SMAD binding; • transcription factor binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • transforming growth factor beta receptor binding; • type I transforming growth factor beta receptor binding; • protein homodimerization activity; • chromatin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв’язування дволанцюгових ДНК; • SMAD binding; • DNA binding; • protein heterodimerization activity; • ubiquitin protein ligase binding; • primary miRNA binding; • disordered domain specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • tau protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинне ядро; • heteromeric SMAD protein complex; • SMAD protein complex; • transcription regulator complex; • внутрішньоклітинний; • нуклеоплазма; • activin responsive factor complex; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• pattern specification process; • ureteric bud development; • endoderm development; • response to cholesterol; • organ growth; • embryonic pattern specification; • zygotic specification of dorsal/ventral axis; • Післязародковий розвиток; • protein phosphorylation; • pericardium development; • regulation of binding; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • negative regulation of cell population proliferation; • cell fate commitment; • common-partner SMAD protein phosphorylation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • SMAD protein signal transduction; • lung development; • signal transduction involved in regulation of gene expression; • insulin secretion; • in utero embryonic development; • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • negative regulation of gene expression; • nodal signaling pathway; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • development of the heart; • pancreas development; • endoderm formation; • activin receptor signaling pathway; • SMAD protein complex assembly; • positive regulation of nodal signaling pathway involved in determination of lateral mesoderm left/right asymmetry; • embryonic foregut morphogenesis; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • response to glucose; • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition; • developmental growth; • гаструляція; • GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing; • positive regulation of BMP signaling pathway; • embryonic cranial skeleton morphogenesis; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • paraxial mesoderm morphogenesis; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • somatic stem cell population maintenance; • mesoderm formation; • regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • anterior/posterior pattern specification; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • protein deubiquitination; • Загоєння ран; • adrenal gland development; • secondary palate development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4087
	17126
	ENSG00000175387
	ENSMUSG00000024563
	Q15796
	Q62432
	NM_001003652; NM_001135937; NM_005901
	NM_001252481; NM_010754; NM_001311070
	NP_001003652; NP_001129409; NP_005892
	NP_001239410; NP_001297999; NP_034884
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SMAD2 (англ. SMAD family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 52 306^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSILPFTPP	VVKRLLGWKK	SAGGSGGAGG	GEQNGQEEKW	CEKAVKSLVK
KLKKTGRLDE	LEKAITTQNC	NTKCVTIPST	CSEIWGLSTP	NTIDQWDTTG
LYSFSEQTRS	LDGRLQVSHR	KGLPHVIYCR	LWRWPDLHSH	HELKAIENCE
YAFNLKKDEV	CVNPYHYQRV	ETPVLPPVLV	PRHTEILTEL	PPLDDYTHSI
PENTNFPAGI	EPQSNYIPET	PPPGYISEDG	ETSDQQLNQS	MDTGSPAELS
PTTLSPVNHS	LDLQPVTYSE	PAFWCSIAYY	ELNQRVGETF	HASQPSLTVD
GFTDPSNSER	FCLGLLSNVN	RNATVEMTRR	HIGRGVRLYY	IGGEVFAECL
SDSAIFVQSP	NCNQRYGWHP	ATVCKIPPGC	NLKIFNNQEF	AALLAQSVNQ
GFEAVYQLTR	MCTIRMSFVK	GWGAEYRRQT	VTSTPCWIEL	HLNGPLQWLD
KVLTQMGSPS	VRCSSMS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Zhang Y., Feng X.-H., Wu R.-Y., Derynck R. (1996). Receptor-associated Mad homologues synergize as effectors of the TGF-beta response. Nature. 383: 168—172. PMID 8774881 doi:10.1038/383168a0
Liu F., Pouponnot C., Massague J. (1997). Dual role of the Smad4/DPC4 tumor suppressor in TGFbeta-inducible transcriptional complexes. Genes Dev. 11: 3157—3167. PMID 9389648 doi:10.1101/gad.11.23.3157
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Tsukazaki T., Chiang T.A., Davison A.F., Attisano L., Wrana J.L. (1998). SARA, a FYVE domain protein that recruits Smad2 to the TGFbeta receptor. Cell. 95: 779—791. PMID 9865696 doi:10.1016/S0092-8674(00)81701-8
Kawabata M., Inoue H., Hanyu A., Imamura T., Miyazono K. (1998). Smad proteins exist as monomers in vivo and undergo homo- and hetero-oligomerization upon activation by serine/threonine kinase receptors. EMBO J. 17: 4056—4065. PMID 9670020 doi:10.1093/emboj/17.14.4056
Kretzschmar M., Liu F., Hata A., Doody J., Massague J. (1997). The TGF-beta family mediator Smad1 is phosphorylated directly and activated functionally by the BMP receptor kinase. Genes Dev. 11: 984—995. PMID 9136927 doi:10.1101/gad.11.8.984

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6768 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-26 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q15796 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6768 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-26 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q15796 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]