| IRF8
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| IRF8, H-ICSBP, ICSBP, ICSBP1, IMD32A, IMD32B, IRF-8, interferon regulatory factor 8 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601565 MGI: 96395 HomoloGene: 1629 GeneCards: IRF8
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| хронічний лімфолейкоз, Інфекція, яку спричинює вірус Епштейна — Барр[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• гіалоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• myeloid cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to bacterium • positive regulation of interleukin-12 production • interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of interferon-gamma production • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • defense response to bacterium • type I interferon signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • Фагоцитоз • cellular response to lipopolysaccharide • defense response to protozoan • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to interferon-gamma • автофагія • процес імунної системи
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 16: 85.9 – 85.92 Mb
| Хр. 8: 121.46 – 121.48 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
IRF8 (англ. Interferon regulatory factor 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 426 амінокислот, а молекулярна маса — 48 356[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MCDRNGGRRL
|
|
RQWLIEQIDS
|
|
SMYPGLIWEN
|
|
EEKSMFRIPW
|
|
KHAGKQDYNQ
|
| EVDASIFKAW
|
|
AVFKGKFKEG
|
|
DKAEPATWKT
|
|
RLRCALNKSP
|
|
DFEEVTDRSQ
|
| LDISEPYKVY
|
|
RIVPEEEQKC
|
|
KLGVATAGCV
|
|
NEVTEMECGR
|
|
SEIDELIKEP
|
| SVDDYMGMIK
|
|
RSPSPPEACR
|
|
SQLLPDWWAQ
|
|
QPSTGVPLVT
|
|
GYTTYDAHHS
|
| AFSQMVISFY
|
|
YGGKLVGQAT
|
|
TTCPEGCRLS
|
|
LSQPGLPGTK
|
|
LYGPEGLELV
|
| RFPPADAIPS
|
|
ERQRQVTRKL
|
|
FGHLERGVLL
|
|
HSSRQGVFVK
|
|
RLCQGRVFCS
|
| GNAVVCKGRP
|
|
NKLERDEVVQ
|
|
VFDTSQFFRE
|
|
LQQFYNSQGR
|
|
LPDGRVVLCF
|
| GEEFPDMAPL
|
|
RSKLILVQIE
|
|
QLYVRQLAEE
|
|
AGKSCGAGSV
|
|
MQAPEEPPPD
|
| QVFRMFPDIC
|
|
ASHQRSFFRE
|
|
NQQITV
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|