SIX4

SIX4
Ідентифікатори
Символи	SIX4, AREC3, SIX homeobox 4
Зовнішні ІД	OMIM: 606342 MGI: 106034 HomoloGene: 69089 GeneCards: SIX4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • transcription regulator complex;
Біологічний процес	• tongue development; • trigeminal ganglion development; • sarcomere organization; • generation of neurons; • regulation of branch elongation involved in ureteric bud branching; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis; • transcription, DNA-templated; • multicellular organism development; • negative regulation of satellite cell differentiation; • pharyngeal system development; • anatomical structure morphogenesis; • embryonic skeletal system morphogenesis; • inner ear morphogenesis; • myotome development; • fungiform papilla morphogenesis; • skeletal muscle fiber differentiation; • positive regulation of ureteric bud formation; • регуляція експресії генів; • embryonic cranial skeleton morphogenesis; • GO:1903374 anatomical structure development; • regulation of synaptic assembly at neuromuscular junction; • olfactory placode formation; • myoblast migration; • thymus development; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • regulation of epithelial cell proliferation; • metanephric mesenchyme development; • male sex determination; • skeletal muscle tissue development; • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • regulation of protein localization; • диференціація чоловічої статі; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • male gonad development; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • protein localization to nucleus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	51804
	20474
	ENSG00000100625
	ENSMUSG00000034460
	Q9UIU6
	Q61321
	NM_017420
	NM_011382; NM_001362272
	NP_059116
	NP_035512; NP_001349201
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SIX4 (англ. SIX homeobox 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 781 амінокислот, а молекулярна маса — 82 933^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSSSPTGQI	ASAADIKQEN	GMESASEGQE	AHREVAGGAA	VGLSPPAPAP
FPLEPGDAAT	AAARVSGEEG	AVAAAAAGAA	ADQVQLHSEL	LGRHHHAAAA
AAQTPLAFSP	DHVACVCEAL	QQGGNLDRLA	RFLWSLPQSD	LLRGNESLLK
ARALVAFHQG	IYPELYSILE	SHSFESANHP	LLQQLWYKAR	YTEAERARGR
PLGAVDKYRL	RRKFPLPRTI	WDGEETVYCF	KEKSRNALKE	LYKQNRYPSP
AEKRHLAKIT	GLSLTQVSNW	FKNRRQRDRN	PSETQSKSES	DGNPSTEDES
SKGHEDLSPH	PLSSSSDGIT	NLSLSSHMEP	VYMQQIGNAK	ISLSSSGVLL
NGSLVPASTS	PVFLNGNSFI	QGPSGVILNG	LNVGNTQAVA	LNPPKMSSNI
VSNGISMTDI	LGSTSQDVKE	FKVLQSSANS	ATTTSYSPSV	PVSFPGLIPS
TEVKREGIQT	VASQDGGSVV	TFTTPVQINQ	YGIVQIPNSG	ANSQFLNGSI
GFSPLQLPPV	SVAASQGNIS	VSSSTSDGST	FTSESTTVQQ	GKVFLSSLAP
SAVVYTVPNT	GQTIGSVKQE	GLERSLVFSQ	LMPVNQNAQV	NANLSSENIS
GSGLHPLASS	LVNVSPTHNF	SLSPSTLLNP	TELNRDIADS	QPMSAPVASK
STVTSVSNTN	YATLQNCSLI	TGQDLLSVPM	TQAALGEIVP	TAEDQVGHPS
PAVHQDFVQE	HRLVLQSVAN	MKENFLSNSE	SKATSSLMML	DSKSKYVLDG
MVDTVCEDLE	TDKKELAKLQ	TVQLDEDMQD	L

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10890 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UIU6 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10890 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9UIU6 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]