NEUROD1

NEUROD1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2QL2
Ідентифікатори
Символи	NEUROD1, BETA2, BHF-1, MODY6, NEUROD, bHLHa3, neuronal differentiation 1, T2D
Зовнішні ІД	OMIM: 601724 MGI: 1339708 HomoloGene: 1871 GeneCards: NEUROD1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • DNA binding; • protein dimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor binding; • chromatin binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • E-box binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • зв’язування дволанцюгових ДНК; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • внутрішньоклітинний; • нуклеоплазма; • RNA polymerase II transcription regulator complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• positive regulation of transcription regulatory region DNA binding; • regulation of neuron differentiation; • Нейрогенез; • диференціація клітин; • cell fate commitment; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • pancreatic PP cell fate commitment; • glucose homeostasis; • regulation of insulin secretion; • enteroendocrine cell differentiation; • dentate gyrus development; • signal transduction involved in regulation of gene expression; • neuron development; • insulin secretion; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • response to glucose; • transcription by RNA polymerase II; • embryonic organ morphogenesis; • cerebellum development; • transcription, DNA-templated; • нейробіологія розвитку; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • multicellular organism development; • hindbrain development; • nucleocytoplasmic transport; • positive regulation of neuron differentiation; • positive regulation of cell differentiation; • nitric oxide mediated signal transduction; • positive regulation of apoptotic process; • regulation of intestinal epithelial structure maintenance; • inner ear development; • camera-type eye development; • pancreatic A cell fate commitment; • amacrine cell differentiation; • negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process; • cellular response to glucose stimulus; • anterior/posterior pattern specification; • endocrine pancreas development; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4760
	18012
	ENSG00000162992
	ENSMUSG00000034701
	Q13562
	Q60867
	NM_002500
	NM_010894
	NP_002491
	NP_035024
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NEUROD1 (англ. Neuronal differentiation 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 356 амінокислот, а молекулярна маса — 39 920^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTKSYSESGL	MGEPQPQGPP	SWTDECLSSQ	DEEHEADKKE	DDLETMNAEE
DSLRNGGEEE	DEDEDLEEEE	EEEEEDDDQK	PKRRGPKKKK	MTKARLERFK
LRRMKANARE	RNRMHGLNAA	LDNLRKVVPC	YSKTQKLSKI	ETLRLAKNYI
WALSEILRSG	KSPDLVSFVQ	TLCKGLSQPT	TNLVAGCLQL	NPRTFLPEQN
QDMPPHLPTA	SASFPVHPYS	YQSPGLPSPP	YGTMDSSHVF	HVKPPPHAYS
AALEPFFESP	LTDCTSPSFD	GPLSPPLSIN	GNFSFKHEPS	AEFEKNYAFT
MHYPAATLAG	AQSHGSIFSG	TAAPRCEIPI	DNIMSFDSHS	HHERVMSAQL
NAIFHD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, нейрогенез, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Miyachi T., Maruyama H., Kitamura T., Nakamura S., Kawakami H. (1999). Structure and regulation of the human NeuroD (BETA2/BHF1) gene. Brain Res. Mol. Brain Res. 69: 223—231. PMID 10366743 doi:10.1016/S0169-328X(99)00112-6
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Acharya H.R., Dooley C.M., Thoreson W.B., Ahmad I. (1997). cDNA cloning and expression analysis of NeuroD mRNA in human retina. Biochem. Biophys. Res. Commun. 233: 459—463. PMID 9144558 doi:10.1006/bbrc.1997.6483
Ray S.K., Nishitani J., Petry M.W., Fessing M.Y., Leiter A.B. (2003). Novel transcriptional potentiation of BETA2/NeuroD on the secretin gene promoter by the DNA-binding protein Finb/RREB-1. Mol. Cell. Biol. 23: 259—271. PMID 12482979 doi:10.1128/MCB.23.1.259-271.2003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7762 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2016-11-07 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q13562 (англ.) . Архів оригіналу за 25 лютого 2018. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7762 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2016-11-07 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q13562 (англ.) . Архів оригіналу за 25 лютого 2018. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]