| JUNB
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| JUNB, AP-1, JunB proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 165161 MGI: 96647 HomoloGene: 7390 GeneCards: JUNB
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • хроматин • клітинне ядро • transcription factor AP-1 complex • transcription regulator complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• cellular response to calcium ion • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cell death • osteoclast differentiation • labyrinthine layer blood vessel development • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • regulation of cell cycle • васкулогенез • embryonic process involved in female pregnancy • response to lipopolysaccharide • decidualization • regulation of cell population proliferation • trophectodermal cell differentiation • osteoblast differentiation • positive regulation of cell differentiation • response to radiation • osteoblast proliferation • GO:0006928 клітинний процес • response to cAMP • response to mechanical stimulus • transcription, DNA-templated • cellular response to hormone stimulus • response to cytokine • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • відгук на органічну речовину
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 19: 12.79 – 12.79 Mb
| Хр. 8: 85.7 – 85.71 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
JUNB (англ. JunB proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 347 амінокислот, а молекулярна маса — 35 879[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MCTKMEQPFY
|
|
HDDSYTATGY
|
|
GRAPGGLSLH
|
|
DYKLLKPSLA
|
|
VNLADPYRSL
|
| KAPGARGPGP
|
|
EGGGGGSYFS
|
|
GQGSDTGASL
|
|
KLASSELERL
|
|
IVPNSNGVIT
|
| TTPTPPGQYF
|
|
YPRGGGSGGG
|
|
AGGAGGGVTE
|
|
EQEGFADGFV
|
|
KALDDLHKMN
|
| HVTPPNVSLG
|
|
ATGGPPAGPG
|
|
GVYAGPEPPP
|
|
VYTNLSSYSP
|
|
ASASSGGAGA
|
| AVGTGSSYPT
|
|
TTISYLPHAP
|
|
PFAGGHPAQL
|
|
GLGRGASTFK
|
|
EEPQTVPEAR
|
| SRDATPPVSP
|
|
INMEDQERIK
|
|
VERKRLRNRL
|
|
AATKCRKRKL
|
|
ERIARLEDKV
|
| KTLKAENAGL
|
|
SSTAGLLREQ
|
|
VAQLKQKVMT
|
|
HVSNGCQLLL
|
|
GVKGHAF
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Phinney D.G., Tseng S.W., Ryder K. (1995). Complex genetic organization of junB: multiple blocks of flanking evolutionarily conserved sequence at the murine and human junB loci. Genomics. 28: 228—234. PMID 8530030 doi:10.1006/geno.1995.1135
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 doi:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|