PHF3 (англ. PHD finger protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 039 амінокислот, а молекулярна маса — 229 481[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDIVDTFNHL
|
|
IPTEHLDDAL
|
|
FLGSNLENEV
|
|
CEDFSASQNV
|
|
LEDSLKNMLS
|
| DKDPMLGSAS
|
|
NQFCLPVLDS
|
|
NDPNFQMPCS
|
|
TVVGLDDIMD
|
|
EGVVKESGND
|
| TIDEEELILP
|
|
NRNLRDKVEE
|
|
NSVRSPRKSP
|
|
RLMAQEQVRS
|
|
LRQSTIAKRS
|
| NAAPLSNTKK
|
|
ASGKTVSTAK
|
|
AGVKQPERSQ
|
|
VKEEVCMSLK
|
|
PEYHKENRRC
|
| SRNSGQIEVV
|
|
PEVSVSSSHS
|
|
SVSSCLEMKD
|
|
EDGLDSKHKC
|
|
NNPGEIDVPS
|
| HELNCSLLSE
|
|
TCVTIGEKKN
|
|
EALMECKAKP
|
|
VGSPLFKFSD
|
|
KEEHEQNDSI
|
| SGKTGETVVE
|
|
EMIATRKVEQ
|
|
DSKETVKLSH
|
|
EDDHILEDAG
|
|
SSDISSDAAC
|
| TNPNKTENSL
|
|
VGLPSCVDEV
|
|
TECNLELKDT
|
|
MGIADKTENT
|
|
LERNKIEPLG
|
| YCEDAESNRQ
|
|
LESTEFNKSN
|
|
LEVVDTSTFG
|
|
PESNILENAI
|
|
CDVPDQNSKQ
|
| LNAIESTKIE
|
|
SHETANLQDD
|
|
RNSQSSSVSY
|
|
LESKSVKSKH
|
|
TKPVIHSKQN
|
| MTTDAPKKIV
|
|
AAKYEVIHSK
|
|
TKVNVKSVKR
|
|
NTDVPESQQN
|
|
FHRPVKVRKK
|
| QIDKEPKIQS
|
|
CNSGVKSVKN
|
|
QAHSVLKKTL
|
|
QDQTLVQIFK
|
|
PLTHSLSDKS
|
| HAHPGCLKEP
|
|
HHPAQTGHVS
|
|
HSSQKQCHKP
|
|
QQQAPAMKTN
|
|
SHVKEELEHP
|
| GVEHFKEEDK
|
|
LKLKKPEKNL
|
|
QPRQRRSSKS
|
|
FSLDEPPLFI
|
|
PDNIATIRRE
|
| GSDHSSSFES
|
|
KYMWTPSKQC
|
|
GFCKKPHGNR
|
|
FMVGCGRCDD
|
|
WFHGDCVGLS
|
| LSQAQQMGEE
|
|
DKEYVCVKCC
|
|
AEEDKKTEIL
|
|
DPDTLENQAT
|
|
VEFHSGDKTM
|
| ECEKLGLSKH
|
|
TTNDRTKYID
|
|
DTVKHKVKIL
|
|
KRESGEGRNS
|
|
SDCRDNEIKK
|
| WQLAPLRKMG
|
|
QPVLPRRSSE
|
|
EKSEKIPKES
|
|
TTVTCTGEKA
|
|
SKPGTHEKQE
|
| MKKKKVEKGV
|
|
LNVHPAASAS
|
|
KPSADQIRQS
|
|
VRHSLKDILM
|
|
KRLTDSNLKV
|
| PEEKAAKVAT
|
|
KIEKELFSFF
|
|
RDTDAKYKNK
|
|
YRSLMFNLKD
|
|
PKNNILFKKV
|
| LKGEVTPDHL
|
|
IRMSPEELAS
|
|
KELAAWRRRE
|
|
NRHTIEMIEK
|
|
EQREVERRPI
|
| TKITHKGEIE
|
|
IESDAPMKEQ
|
|
EAAMEIQEPA
|
|
ANKSLEKPEG
|
|
SEKQKEEVDS
|
| MSKDTTSQHR
|
|
QHLFDLNCKI
|
|
CIGRMAPPVD
|
|
DLSPKKVKVV
|
|
VGVARKHSDN
|
| EAESIADALS
|
|
STSNILASEF
|
|
FEEEKQESPK
|
|
STFSPAPRPE
|
|
MPGTVEVEST
|
| FLARLNFIWK
|
|
GFINMPSVAK
|
|
FVTKAYPVSG
|
|
SPEYLTEDLP
|
|
DSIQVGGRIS
|
| PQTVWDYVEK
|
|
IKASGTKEIC
|
|
VVRFTPVTEE
|
|
DQISYTLLFA
|
|
YFSSRKRYGV
|
| AANNMKQVKD
|
|
MYLIPLGATD
|
|
KIPHPLVPFD
|
|
GPGLELHRPN
|
|
LLLGLIIRQK
|
| LKRQHSACAS
|
|
TSHIAETPES
|
|
APPIALPPDK
|
|
KSKIEVSTEE
|
|
APEEENDFFN
|
| SFTTVLHKQR
|
|
NKPQQNLQED
|
|
LPTAVEPLME
|
|
VTKQEPPKPL
|
|
RFLPGVLIGW
|
| ENQPTTLELA
|
|
NKPLPVDDIL
|
|
QSLLGTTGQV
|
|
YDQAQSVMEQ
|
|
NTVKEIPFLN
|
| EQTNSKIEKT
|
|
DNVEVTDGEN
|
|
KEIKVKVDNI
|
|
SESTDKSAEI
|
|
ETSVVGSSSI
|
| SAGSLTSLSL
|
|
RGKPPDVSTE
|
|
AFLTNLSIQS
|
|
KQEETVESKE
|
|
KTLKRQLQED
|
| QENNLQDNQT
|
|
SNSSPCRSNV
|
|
GKGNIDGNVS
|
|
CSENLVANTA
|
|
RSPQFINLKR
|
| DPRQAAGRSQ
|
|
PVTTSESKDG
|
|
DSCRNGEKHM
|
|
LPGLSHNKEH
|
|
LTEQINVEEK
|
| LCSAEKNSCV
|
|
QQSDNLKVAQ
|
|
NSPSVENIQT
|
|
SQAEQAKPLQ
|
|
EDILMQNIET
|
| VHPFRRGSAV
|
|
ATSHFEVGNT
|
|
CPSEFPSKSI
|
|
TFTSRSTSPR
|
|
TSTNFSPMRP
|
| QQPNLQHLKS
|
|
SPPGFPFPGP
|
|
PNFPPQSMFG
|
|
FPPHLPPPLL
|
|
PPPGFGFAQN
|
| PMVPWPPVVH
|
|
LPGQPQRMMG
|
|
PLSQASRYIG
|
|
PQNFYQVKDI
|
|
RRPERRHSDP
|
| WGRQDQQQLD
|
|
RPFNRGKGDR
|
|
QRFYSDSHHL
|
|
KRERHEKEWE
|
|
QESERHRRRD
|
| RSQDKDRDRK
|
|
SREEGHKDKE
|
|
RARLSHGDRG
|
|
TDGKASRDSR
|
|
NVDKKPDKPK
|
| SEDYEKDKER
|
|
EKSKHREGEK
|
|
DRDRYHKDRD
|
|
HTDRTKSKR
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|