NFYB

NFYB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1N1J, 4AWL, 4CSR
Ідентифікатори
Символи	NFYB, CBF-A, CBF-B, HAP3, NF-YB, nuclear transcription factor Y subunit beta
Зовнішні ІД	OMIM: 189904 MGI: 97317 HomoloGene: 38149 GeneCards: NFYB
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• protein-DNA complex; • нуклеоплазма; • CCAAT-binding factor complex; • клітинне ядро; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of cholesterol biosynthetic process; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4801
	18045
	ENSG00000120837
	ENSMUSG00000020248
	P25208
	P63139
	NM_006166
	NM_010914
	NP_006157; NP_006157.1
	NP_035044
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NFYB (англ. Nuclear transcription factor Y subunit beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 207 амінокислот, а молекулярна маса — 22 831^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTMDGDSSTT	DASQLGISAD	YIGGSHYVIQ	PHDDTEDSMN	DHEDTNGSKE
SFREQDIYLP	IANVARIMKN	AIPQTGKIAK	DAKECVQECV	SEFISFITSE
ASERCHQEKR	KTINGEDILF	AMSTLGFDSY	VEPLKLYLQK	FREAMKGEKG
IGGAVTATDG	LSEELTEEAF	TNQLPAGLIT	TDGQQQNVMV	YTTSYQQISG
VQQIQFS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Chattopadhyay C., Hawke D., Kobayashi R., Maity S.N. (2004). Human p32, interacts with B subunit of the CCAAT-binding factor, CBF/NF-Y, and inhibits CBF-mediated transcription activation in vitro. Nucleic Acids Res. 32: 3632—3641. PMID 15243141 doi:10.1093/nar/gkh692
Romier C., Cocchiarella F., Mantovani R., Moras D. (2003). The NF-YB/NF-YC structure gives insight into DNA binding and transcription regulation by CCAAT factor NF-Y. J. Biol. Chem. 278: 1336—1345. PMID 12401788 doi:10.1074/jbc.M209635200
Li X.-Y., Hooft van Huijsduijnen R., Mantovani R., Benoist C.O., Mathis D. (1992). Intron-exon organization of the NF-Y genes. Tissue-specific splicing modifies an activation domain. J. Biol. Chem. 267: 8984—8990. PMID 1577736

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7805 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P25208 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7805 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P25208 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]