CEBPA

CEBPA
Ідентифікатори
Символи	CEBPA, C/EBP-alpha, CEBP, CCAAT/enhancer binding protein alpha, CCAAT enhancer binding protein alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 116897 MGI: 99480 HomoloGene: 3211 GeneCards: CEBPA
Пов'язані генетичні захворювання
	гострий мієлоїдний лейкоз
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • protein homodimerization activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • transcription factor binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • kinase binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• transcription regulator complex; • RNA polymerase II transcription regulator complex; • ядерце; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• Сигнальний шлях Notch; • transcription by RNA polymerase I; • myeloid cell differentiation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to lithium ion; • glucose homeostasis; • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; • lung development; • cytokine-mediated signaling pathway; • цикл сечовини; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound; • mitochondrion organization; • embryonic placenta development; • cholesterol metabolic process; • negative regulation of cell cycle; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • cell maturation; • generation of precursor metabolites and energy; • transcription, DNA-templated; • macrophage differentiation; • multicellular organism development; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • positive regulation of osteoblast differentiation; • granulocyte differentiation; • regulation of cell population proliferation; • brown fat cell differentiation; • lipid homeostasis; • white fat cell differentiation; • inner ear development; • liver development; • GO:0022415 viral process; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of fat cell differentiation; • positive regulation of transcription by RNA polymerase III; • fat cell differentiation; • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of cell population proliferation; • transcription by RNA polymerase II; • cellular response to tumor necrosis factor; • positive regulation of DNA-templated transcription, initiation; • positive regulation of macrophage activation; • positive regulation of inflammatory response; • interleukin-6-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1050
	12606
	ENSG00000245848
	ENSMUSG00000034957
	P49715
	P53566
	NM_004364; NM_001285829; NM_001287424; NM_001287435
	NM_001287514; NM_001287515; NM_001287521; NM_001287523; NM_007678
	NP_001272758; NP_001274353; NP_001274364; NP_004355
	NP_001274443; NP_001274444; NP_001274450; NP_001274452; NP_031704
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CEBPA (англ. CCAAT/enhancer binding protein alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 358 амінокислот, а молекулярна маса — 37 561^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESADFYEAE	PRPPMSSHLQ	SPPHAPSSAA	FGFPRGAGPA	QPPAPPAAPE
PLGGICEHET	SIDISAYIDP	AAFNDEFLAD	LFQHSRQQEK	AKAAVGPTGG
GGGGDFDYPG	APAGPGGAVM	PGGAHGPPPG	YGCAAAGYLD	GRLEPLYERV
GAPALRPLVI	KQEPREEDEA	KQLALAGLFP	YQPPPPPPPS	HPHPHPPPAH
LAAPHLQFQI	AHCGQTTMHL	QPGHPTPPPT	PVPSPHPAPA	LGAAGLPGPG
SALKGLGAAH	PDLRASGGSG	AGKAKKSVDK	NSNEYRVRRE	RNNIAVRKSR
DKAKQRNVET	QQKVLELTSD	NDRLRKRVEQ	LSRELDTLRG	IFRQLPESSL
VKAMGNCA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Antonson P., Xanthopoulos K.G. (1995). Molecular cloning, sequence, and expression patterns of the human gene encoding CCAAT/enhancer binding protein alpha (C/EBP alpha). Biochem. Biophys. Res. Commun. 215: 106—113. PMID 7575576 doi:10.1006/bbrc.1995.2439
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Choi B.H., Park G.T., Rho H.M. (1999). Interaction of hepatitis B viral X protein and CCAAT/enhancer-binding protein alpha synergistically activates the hepatitis B viral enhancer II/pregenomic promoter. J. Biol. Chem. 274: 2858—2865. PMID 9915821 doi:10.1074/jbc.274.5.2858
Wang G.L., Iakova P., Wilde M., Awad S., Timchenko N.A. (2004). Liver tumors escape negative control of proliferation via PI3K/Akt-mediated block of C/EBP alpha growth inhibitory activity. Genes Dev. 18: 912—925. PMID 15107404 doi:10.1101/gad.1183304
Muller C., Calkhoven C.F., Sha X., Leutz A. (2004). The CCAAT enhancer-binding protein alpha (C/EBPalpha) requires a SWI/SNF complex for proliferation arrest. J. Biol. Chem. 279: 7353—7358. PMID 14660596 doi:10.1074/jbc.M312709200
Smith M.L., Cavenagh J.D., Lister T.A., Fitzgibbon J. (2004). Mutation of CEBPA in familial acute myeloid leukemia. N. Engl. J. Med. 351: 2403—2407. PMID 15575056 doi:10.1056/NEJMoa041331

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CEBPA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1833 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-31 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P49715 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CEBPA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1833 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-31 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P49715 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]