IRX2

IRX2
Ідентифікатори
Символи	IRX2, IRXA2, iroquois homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 606198 MGI: 1197526 HomoloGene: 56490 GeneCards: IRX2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• specification of loop of Henle identity; • metanephros development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • proximal/distal pattern formation involved in metanephric nephron development; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	153572
	16372
	ENSG00000170561
	ENSMUSG00000001504
	Q9BZI1
	P81066
	NM_001134222; NM_033267
	NM_010574
	NP_001127694; NP_150366
	NP_034704
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

IRX2 (англ. Iroquois homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 471 амінокислот, а молекулярна маса — 49 129^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSYPQGYLYQ	APGSLALYSC	PAYGASALAA	PRSEELARSA	SGSAFSPYPG
SAAFTAQAAT	GFGSPLQYSA	DAAAAAAGFP	SYMGAPYDAH	TTGMTGAISY
HPYGSAAYPY	QLNDPAYRKN	ATRDATATLK	AWLNEHRKNP	YPTKGEKIML
AIITKMTLTQ	VSTWFANARR	RLKKENKMTW	APRNKSEDED	EDEGDATRSK
DESPDKAQEG	TETSAEDEGI	SLHVDSLTDH	SCSAESDGEK	LPCRAGDPLC
ESGSECKDKY	DDLEDDEDDD	EEGERGLAPP	KPVTSSPLTG	LEAPLLSPPP
EAAPRGGRKT	PQGSRTSPGA	PPPASKPKLW	SLAEIATSDL	KQPSLGPGCG
PPGLPAAAAP	ASTGAPPGGS	PYPASPLLGR	PLYYTSPFYG	NYTNYGNLNA
ALQGQGLLRY	NSAAAAPGEA	LHTAPKAASD	AGKAGAHPLE	SHYRSPGGGY
EPKKDASEGC	TVVGGGVQPY	L

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14359 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9BZI1 (англ.) . Архів оригіналу за 3 грудня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14359 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9BZI1 (англ.) . Архів оригіналу за 3 грудня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]