| PPARD
|
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
| Список кодів PDB |
|
1GWX, 1Y0S, 2AWH, 2B50, 2BAW, 2ENV, 2GWX, 2J14, 2Q5G, 2XYJ, 2XYW, 2XYX, 2ZNP, 2ZNQ, 3D5F, 3DY6, 3ET2, 3GWX, 3GZ9, 3OZ0, 3PEQ, 3SP9, 3TKM
| | |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| PPARD, FAAR, NR1C2, NUC1, NUCI, NUCII, PPARB, peroxisome proliferator activated receptor delta |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600409 MGI: 101884 HomoloGene: 4544 GeneCards: PPARD
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| цукровий діабет 2-го типу, diabetic cataract[1] |
|
|
| Реагує на сполуку |
|---|
| GW0742X, GW-501516, третиноїн, elafibranor, sodelglitazar, indeglitazar[2] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • зв’язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • fatty acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • linoleic acid binding • protein heterodimerization activity • lipid binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • NF-kappaB binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро • RNA polymerase II transcription regulator complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• fatty acid catabolic process • positive regulation of myoblast proliferation • positive regulation of epidermis development • диференціація клітин • negative regulation of smooth muscle cell proliferation • negative regulation of myoblast differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • placenta development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of smooth muscle cell migration • Загоєння ран • mRNA transcription • cholesterol metabolic process • negative regulation of apoptotic process • response to glucose • response to activity • відгук на органічну речовину • generation of precursor metabolites and energy • regulation of fat cell differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • response to vitamin A • development of the heart • cell-substrate adhesion • keratinocyte proliferation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • proteoglycan metabolic process • regulation of cell population proliferation • negative regulation of cell growth • fatty acid oxidation • positive regulation of cell population proliferation • glucose metabolic process • phospholipid biosynthetic process • negative regulation of epithelial cell proliferation • positive regulation of skeletal muscle tissue regeneration • apoptotic signaling pathway • vitamin A metabolic process • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • keratinocyte migration • adipose tissue development • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of skeletal muscle satellite cell proliferation • positive regulation of fat cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of inflammatory response • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to hypoxia • negative regulation of collagen biosynthetic process • positive regulation of insulin secretion • steroid hormone mediated signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • проліферація • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • intracellular receptor signaling pathway • axon ensheathment • decidualization • fatty acid transport • embryo implantation • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • Обмін жирів • fatty acid beta-oxidation • glucose transmembrane transport • fatty acid metabolic process • multicellular organism development • hormone-mediated signaling pathway • negative regulation of cholesterol storage • regulation of lipid metabolic process • response to lipid • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 6: 35.34 – 35.43 Mb
| Хр. 17: 28.23 – 28.3 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[3]
| [4] |
|---|
| Вікідані |
|
PPARD (англ. Peroxisome proliferator activated receptor delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 49 903[6].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MEQPQEEAPE
|
|
VREEEEKEEV
|
|
AEAEGAPELN
|
|
GGPQHALPSS
|
|
SYTDLSRSSS
|
| PPSLLDQLQM
|
|
GCDGASCGSL
|
|
NMECRVCGDK
|
|
ASGFHYGVHA
|
|
CEGCKGFFRR
|
| TIRMKLEYEK
|
|
CERSCKIQKK
|
|
NRNKCQYCRF
|
|
QKCLALGMSH
|
|
NAIRFGRMPE
|
| AEKRKLVAGL
|
|
TANEGSQYNP
|
|
QVADLKAFSK
|
|
HIYNAYLKNF
|
|
NMTKKKARSI
|
| LTGKASHTAP
|
|
FVIHDIETLW
|
|
QAEKGLVWKQ
|
|
LVNGLPPYKE
|
|
ISVHVFYRCQ
|
| CTTVETVREL
|
|
TEFAKSIPSF
|
|
SSLFLNDQVT
|
|
LLKYGVHEAI
|
|
FAMLASIVNK
|
| DGLLVANGSG
|
|
FVTREFLRSL
|
|
RKPFSDIIEP
|
|
KFEFAVKFNA
|
|
LELDDSDLAL
|
| FIAAIILCGD
|
|
RPGLMNVPRV
|
|
EAIQDTILRA
|
|
LEFHLQANHP
|
|
DAQYLFPKLL
|
| QKMADLRQLV
|
|
TEHAQMMQRI
|
|
KKTETETSLH
|
|
PLLQEIYKDM
|
|
Y
|
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system. FEBS Lett. 582: 2737—2744. PMID 18619963 doi:10.1016/j.febslet.2008.07.003
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|