PPARD

PPARD
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PPARD, FAAR, NR1C2, NUC1, NUCI, NUCII, PPARB, peroxisome proliferator activated receptor delta
Зовнішні ІД OMIM: 600409 MGI: 101884 HomoloGene: 4544 GeneCards: PPARD
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 2-го типу, diabetic cataract[1]
Реагує на сполуку
GW0742X, GW-501516, третиноїн, elafibranor, sodelglitazar, indeglitazar[2]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5467
19015
Ensembl
ENSG00000112033
ENSMUSG00000002250
UniProt
Q03181
P35396
RefSeq (мРНК)
NM_001171818
NM_001171819
NM_001171820
NM_006238
NM_177435
NM_011145
RefSeq (білок)
NP_001165289
NP_001165290
NP_001165291
NP_006229
NP_803184
NP_035275
Локус (UCSC) Хр. 6: 35.34 – 35.43 Mb Хр. 17: 28.23 – 28.3 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PPARD (англ. Peroxisome proliferator activated receptor delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 49 903[6].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEQPQEEAPE VREEEEKEEV AEAEGAPELN GGPQHALPSS SYTDLSRSSS
PPSLLDQLQM GCDGASCGSL NMECRVCGDK ASGFHYGVHA CEGCKGFFRR
TIRMKLEYEK CERSCKIQKK NRNKCQYCRF QKCLALGMSH NAIRFGRMPE
AEKRKLVAGL TANEGSQYNP QVADLKAFSK HIYNAYLKNF NMTKKKARSI
LTGKASHTAP FVIHDIETLW QAEKGLVWKQ LVNGLPPYKE ISVHVFYRCQ
CTTVETVREL TEFAKSIPSF SSLFLNDQVT LLKYGVHEAI FAMLASIVNK
DGLLVANGSG FVTREFLRSL RKPFSDIIEP KFEFAVKFNA LELDDSDLAL
FIAAIILCGD RPGLMNVPRV EAIQDTILRA LEFHLQANHP DAQYLFPKLL
QKMADLRQLV TEHAQMMQRI KKTETETSLH PLLQEIYKDM Y

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system. FEBS Lett. 582: 2737—2744. PMID 18619963 doi:10.1016/j.febslet.2008.07.003
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

Див. також