| ARNTL
|
|---|
|
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ARNTL, BMAL1, BMAL1c, JAP3, MOP3, PASD3, TIC, bHLHe5, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602550 MGI: 1096381 HomoloGene: 910 GeneCards: ARNTL
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| шизофренія[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • Hsp90 protein binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • aryl hydrocarbon receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • core promoter sequence-specific DNA binding • bHLH transcription factor binding • sequence-specific DNA binding • protein heterodimerization activity • E-box binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • PML body • внутрішньоклітинна мембранна органела • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерні тільця • chromatoid body
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • transcription, DNA-templated • regulation of hair cycle • transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • циркадний ритм • negative regulation of TOR signaling • circadian regulation of gene expression • GO:1903362 regulation of protein catabolic process • positive regulation of circadian rhythm • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of fat cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of neurogenesis • regulation of insulin secretion • regulation of cell cycle • response to redox state • maternal process involved in parturition • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • oxidative stress-induced premature senescence • regulation of type B pancreatic cell development • negative regulation of glucocorticoid receptor signaling pathway • regulation of cellular senescence • positive regulation of skeletal muscle cell differentiation • positive regulation of protein acetylation • negative regulation of cold-induced thermogenesis • protein import into nucleus
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
н/д
| Хр. 7: 112.81 – 112.91 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
ARNTL (англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 626 амінокислот, а молекулярна маса — 68 762[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MADQRMDISS
|
|
TISDFMSPGP
|
|
TDLLSSSLGT
|
|
SGVDCNRKRK
|
|
GSSTDYQESM
|
| DTDKDDPHGR
|
|
LEYTEHQGRI
|
|
KNAREAHSQI
|
|
EKRRRDKMNS
|
|
FIDELASLVP
|
| TCNAMSRKLD
|
|
KLTVLRMAVQ
|
|
HMKTLRGATN
|
|
PYTEANYKPT
|
|
FLSDDELKHL
|
| ILRAADGFLF
|
|
VVGCDRGKIL
|
|
FVSESVFKIL
|
|
NYSQNDLIGQ
|
|
SLFDYLHPKD
|
| IAKVKEQLSS
|
|
SDTAPRERLI
|
|
DAKTGLPVKT
|
|
DITPGPSRLC
|
|
SGARRSFFCR
|
| MKCNRPSVKV
|
|
EDKDFPSTCS
|
|
KKKADRKSFC
|
|
TIHSTGYLKS
|
|
WPPTKMGLDE
|
| DNEPDNEGCN
|
|
LSCLVAIGRL
|
|
HSHVVPQPVN
|
|
GEIRVKSMEY
|
|
VSRHAIDGKF
|
| VFVDQRATAI
|
|
LAYLPQELLG
|
|
TSCYEYFHQD
|
|
DIGHLAECHR
|
|
QVLQTREKIT
|
| TNCYKFKIKD
|
|
GSFITLRSRW
|
|
FSFMNPWTKE
|
|
VEYIVSTNTV
|
|
VLANVLEGGD
|
| PTFPQLTASP
|
|
HSMDSMLPSG
|
|
EGGPKRTHPT
|
|
VPGIPGGTRA
|
|
GAGKIGRMIA
|
| EEIMEIHRIR
|
|
GSSPSSCGSS
|
|
PLNITSTPPP
|
|
DASSPGGKKI
|
|
LNGGTPDIPS
|
| SGLLSGQAQE
|
|
NPGYPYSDSS
|
|
SILGENPHIG
|
|
IDMIDNDQGS
|
|
SSPSNDEAAM
|
| AVIMSLLEAD
|
|
AGLGGPVDFS
|
|
DLPWPL
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Ikeda M., Nomura M. (1997). cDNA cloning and tissue-specific expression of a novel basic helix-loop-helix/PAS protein (BMAL1) and identification of alternatively spliced variants with alternative translation initiation site usage. Biochem. Biophys. Res. Commun. 233: 258—264. PMID 9144434 doi:10.1006/bbrc.1997.6371
- Hogenesch J.B., Gu Y.Z., Jain S., Bradfield C.A. (1998). The basic-helix-loop-helix-PAS orphan MOP3 forms transcriptionally active complexes with circadian and hypoxia factors. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 5474—5479. PMID 9576906 doi:10.1073/pnas.95.10.5474
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Rutter J., Reick M., Wu L.C., McKnight S.L. (2001). Regulation of clock and NPAS2 DNA binding by the redox state of NAD cofactors. Science. 293: 510—514. PMID 11441146 doi:10.1126/science.1060698
- Richards J., Gumz M.L. (2013). Mechanism of the circadian clock in physiology. Am. J. Physiol. 304: R1053—R1064. PMID 23576606 doi:10.1152/ajpregu.00066.2013
- Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 doi:10.1152/physrev.00016.2012
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|