ARNTL

ARNTL
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ARNTL, BMAL1, BMAL1c, JAP3, MOP3, PASD3, TIC, bHLHe5, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like
Зовнішні ІД OMIM: 602550 MGI: 1096381 HomoloGene: 910 GeneCards: ARNTL
Пов'язані генетичні захворювання
шизофренія[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
406
11865
Ensembl
ENSG00000133794
ENSMUSG00000055116
UniProt
O00327
Q9WTL8
RefSeq (мРНК)
NM_001243048
NM_007489
NM_001357070
NM_001368412
NM_001374642
RefSeq (білок)
NP_001229977
NP_031515
NP_001343999
NP_001355341
NP_001361571
Локус (UCSC) н/д Хр. 7: 112.81 – 112.91 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ARNTL (англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 626 амінокислот, а молекулярна маса — 68 762[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MADQRMDISS TISDFMSPGP TDLLSSSLGT SGVDCNRKRK GSSTDYQESM
DTDKDDPHGR LEYTEHQGRI KNAREAHSQI EKRRRDKMNS FIDELASLVP
TCNAMSRKLD KLTVLRMAVQ HMKTLRGATN PYTEANYKPT FLSDDELKHL
ILRAADGFLF VVGCDRGKIL FVSESVFKIL NYSQNDLIGQ SLFDYLHPKD
IAKVKEQLSS SDTAPRERLI DAKTGLPVKT DITPGPSRLC SGARRSFFCR
MKCNRPSVKV EDKDFPSTCS KKKADRKSFC TIHSTGYLKS WPPTKMGLDE
DNEPDNEGCN LSCLVAIGRL HSHVVPQPVN GEIRVKSMEY VSRHAIDGKF
VFVDQRATAI LAYLPQELLG TSCYEYFHQD DIGHLAECHR QVLQTREKIT
TNCYKFKIKD GSFITLRSRW FSFMNPWTKE VEYIVSTNTV VLANVLEGGD
PTFPQLTASP HSMDSMLPSG EGGPKRTHPT VPGIPGGTRA GAGKIGRMIA
EEIMEIHRIR GSSPSSCGSS PLNITSTPPP DASSPGGKKI LNGGTPDIPS
SGLLSGQAQE NPGYPYSDSS SILGENPHIG IDMIDNDQGS SSPSNDEAAM
AVIMSLLEAD AGLGGPVDFS DLPWPL

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Ikeda M., Nomura M. (1997). cDNA cloning and tissue-specific expression of a novel basic helix-loop-helix/PAS protein (BMAL1) and identification of alternatively spliced variants with alternative translation initiation site usage. Biochem. Biophys. Res. Commun. 233: 258—264. PMID 9144434 doi:10.1006/bbrc.1997.6371
  • Hogenesch J.B., Gu Y.Z., Jain S., Bradfield C.A. (1998). The basic-helix-loop-helix-PAS orphan MOP3 forms transcriptionally active complexes with circadian and hypoxia factors. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 5474—5479. PMID 9576906 doi:10.1073/pnas.95.10.5474
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Rutter J., Reick M., Wu L.C., McKnight S.L. (2001). Regulation of clock and NPAS2 DNA binding by the redox state of NAD cofactors. Science. 293: 510—514. PMID 11441146 doi:10.1126/science.1060698
  • Richards J., Gumz M.L. (2013). Mechanism of the circadian clock in physiology. Am. J. Physiol. 304: R1053—R1064. PMID 23576606 doi:10.1152/ajpregu.00066.2013
  • Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 doi:10.1152/physrev.00016.2012

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ARNTL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:701 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, O00327 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також