HMGA1

HMGA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EZD, 2EZE, 2EZF, 2EZG
Ідентифікатори
Символи	HMGA1, HMG-R, HMGA1A, HMGIY, high mobility group AT-hook 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600701 MGI: 96160 HomoloGene: 128226 GeneCards: HMGA1
Онтологія гена Молекулярна функція • retinoid X receptor binding • retinoic acid receptor binding • enzyme binding • peroxisome proliferator activated receptor binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • nuclear receptor coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity • transcription factor binding • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • structural constituent of chromatin Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • senescence-associated heterochromatin focus • хромосома • focal adhesion • transcription regulator complex • хроматин • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • negative regulation of cell population proliferation • oncogene-induced cell senescence • establishment of integrated proviral latency • nucleosome disassembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cellular senescence • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • response to virus • DNA unwinding involved in DNA replication • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • nuclear transport • GO:0022415 viral process • base-excision repair • GO:0034622 protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3159	15361
Ensembl	ENSG00000137309	ENSMUSG00000046711
UniProt	P17096	P17095
RefSeq (мРНК)	NM_002131 NM_145899 NM_145901 NM_145902 NM_145903 NM_145904 NM_145905 NM_001319077 NM_001319078 NM_001319079 NM_001319080 NM_001319081 NM_001319082	NM_001025427 NM_001039356 NM_001166535 NM_001166536 NM_001166537 NM_001166539 NM_001166540 NM_001166541 NM_001166542 NM_001166543 NM_001166544 NM_001166545 NM_001166546 NM_016660
RefSeq (білок)	NP_001306006 NP_001306007 NP_001306008 NP_001306009 NP_001306010 NP_001306011 NP_002122 NP_665906 NP_665908 NP_665909 NP_665910 NP_665912	NP_001159948 NP_001159949 NP_001020598 NP_001034445 NP_001160007 NP_001160008 NP_001160009 NP_001160011 NP_001160012 NP_001160013 NP_001160014 NP_001160015 NP_001160016 NP_001160017 NP_001160018 NP_057869
Локус (UCSC)	Хр. 6: 34.24 – 34.25 Mb	Хр. 17: 27.78 – 27.78 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HMGA1 (англ. High mobility group AT-hook 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 107 амінокислот, а молекулярна маса — 11 676^[4].

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

• Хромосома 6