| MEIS1
|
|---|
|
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| MEIS1, Meis homeobox 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601739 MGI: 104717 HomoloGene: 135741 GeneCards: MEIS1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| синдром неспокійних ніг[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• transcription regulator complex • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• megakaryocyte development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • blood vessel morphogenesis • negative regulation of neuron differentiation • locomotory behavior • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • lens morphogenesis in camera-type eye • Ангіогенез • definitive hemopoiesis • negative regulation of myeloid cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cardiac muscle cell proliferation • кровотворення
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 66.43 – 66.57 Mb
| Хр. 11: 18.83 – 18.97 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
MEIS1 (англ. Meis homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 43 016[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAQRYDDLPH
|
|
YGGMDGVGIP
|
|
STMYGDPHAA
|
|
RSMQPVHHLN
|
|
HGPPLHSHQY
|
| PHTAHTNAMA
|
|
PSMGSSVNDA
|
|
LKRDKDAIYG
|
|
HPLFPLLALI
|
|
FEKCELATCT
|
| PREPGVAGGD
|
|
VCSSESFNED
|
|
IAVFAKQIRA
|
|
EKPLFSSNPE
|
|
LDNLMIQAIQ
|
| VLRFHLLELE
|
|
KVHELCDNFC
|
|
HRYISCLKGK
|
|
MPIDLVIDDR
|
|
EGGSKSDSED
|
| ITRSANLTDQ
|
|
PSWNRDHDDT
|
|
ASTRSGGTPG
|
|
PSSGGHTSHS
|
|
GDNSSEQGDG
|
| LDNSVASPST
|
|
GDDDDPDKDK
|
|
KRHKKRGIFP
|
|
KVATNIMRAW
|
|
LFQHLTHPYP
|
| SEEQKKQLAQ
|
|
DTGLTILQVN
|
|
NWFINARRRI
|
|
VQPMIDQSNR
|
|
AVSQGTPYNP
|
| DGQPMGGFVM
|
|
DGQQHMGIRA
|
|
PGPMSGMGMN
|
|
MGMEGQWHYM
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Smith J.E. Jr., Bollekens J.A., Inghirami G., Takeshita K. (1997). Cloning and mapping of the MEIS1 gene, the human homolog of a murine leukemogenic gene. Genomics. 43: 99—103. PMID 9226379 doi:10.1006/geno.1997.4766
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|