| EPAS1
|
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
| Список кодів PDB |
|
1P97, 2A24, 3F1N, 3F1O, 3F1P, 3H7W, 3H82, 4GHI, 4GS9, 4PKY, 4XT2
| | |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| EPAS1, ECYT4, HIF2A, HLF, MOP2, PASD2, bHLHe73, endothelial PAS domain protein 1, Hypoxia-inducible factor-2alpha |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 603349 MGI: 109169 HomoloGene: 1095 GeneCards: EPAS1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Рак нирки[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• surfactant homeostasis • диференціація клітин • response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress • lung development • norepinephrine metabolic process • iron ion homeostasis • mitochondrion organization • embryonic placenta development • cell maturation • GO:0001306 response to oxidative stress • transcription, DNA-templated • регуляція серцевого ритму • multicellular organism development • blood vessel remodeling • myoblast fate commitment • Ангіогенез • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • erythrocyte differentiation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • зріння (видіннє) • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to hypoxia • transcription by RNA polymerase II • посттрансляційна модифікація • кровотворення • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cold-induced thermogenesis • Убіквітин-залежний протеоліз
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 46.29 – 46.39 Mb
| Хр. 17: 87.06 – 87.14 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
EPAS1 (англ. Endothelial PAS domain protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 870 амінокислот, а молекулярна маса — 96 459[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MTADKEKKRS
|
|
SSERRKEKSR
|
|
DAARCRRSKE
|
|
TEVFYELAHE
|
|
LPLPHSVSSH
|
| LDKASIMRLA
|
|
ISFLRTHKLL
|
|
SSVCSENESE
|
|
AEADQQMDNL
|
|
YLKALEGFIA
|
| VVTQDGDMIF
|
|
LSENISKFMG
|
|
LTQVELTGHS
|
|
IFDFTHPCDH
|
|
EEIRENLSLK
|
| NGSGFGKKSK
|
|
DMSTERDFFM
|
|
RMKCTVTNRG
|
|
RTVNLKSATW
|
|
KVLHCTGQVK
|
| VYNNCPPHNS
|
|
LCGYKEPLLS
|
|
CLIIMCEPIQ
|
|
HPSHMDIPLD
|
|
SKTFLSRHSM
|
| DMKFTYCDDR
|
|
ITELIGYHPE
|
|
ELLGRSAYEF
|
|
YHALDSENMT
|
|
KSHQNLCTKG
|
| QVVSGQYRML
|
|
AKHGGYVWLE
|
|
TQGTVIYNPR
|
|
NLQPQCIMCV
|
|
NYVLSEIEKN
|
| DVVFSMDQTE
|
|
SLFKPHLMAM
|
|
NSIFDSSGKG
|
|
AVSEKSNFLF
|
|
TKLKEEPEEL
|
| AQLAPTPGDA
|
|
IISLDFGNQN
|
|
FEESSAYGKA
|
|
ILPPSQPWAT
|
|
ELRSHSTQSE
|
| AGSLPAFTVP
|
|
QAAAPGSTTP
|
|
SATSSSSSCS
|
|
TPNSPEDYYT
|
|
SLDNDLKIEV
|
| IEKLFAMDTE
|
|
AKDQCSTQTD
|
|
FNELDLETLA
|
|
PYIPMDGEDF
|
|
QLSPICPEER
|
| LLAENPQSTP
|
|
QHCFSAMTNI
|
|
FQPLAPVAPH
|
|
SPFLLDKFQQ
|
|
QLESKKTEPE
|
| HRPMSSIFFD
|
|
AGSKASLPPC
|
|
CGQASTPLSS
|
|
MGGRSNTQWP
|
|
PDPPLHFGPT
|
| KWAVGDQRTE
|
|
FLGAAPLGPP
|
|
VSPPHVSTFK
|
|
TRSAKGFGAR
|
|
GPDVLSPAMV
|
| ALSNKLKLKR
|
|
QLEYEEQAFQ
|
|
DLSGGDPPGG
|
|
STSHLMWKRM
|
|
KNLRGGSCPL
|
| MPDKPLSANV
|
|
PNDKFTQNPM
|
|
RGLGHPLRHL
|
|
PLPQPPSAIS
|
|
PGENSKSRFP
|
| PQCYATQYQD
|
|
YSLSSAHKVS
|
|
GMASRLLGPS
|
|
FESYLLPELT
|
|
RYDCEVNVPV
|
| LGSSTLLQGG
|
|
DLLRALDQAT
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ангіогенез, диференціація, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|