EPAS1

EPAS1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи EPAS1, ECYT4, HIF2A, HLF, MOP2, PASD2, bHLHe73, endothelial PAS domain protein 1, Hypoxia-inducible factor-2alpha
Зовнішні ІД OMIM: 603349 MGI: 109169 HomoloGene: 1095 GeneCards: EPAS1
Пов'язані генетичні захворювання
Рак нирки[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2034
13819
Ensembl
ENSG00000116016
ENSMUSG00000024140
UniProt
Q99814
P97481
RefSeq (мРНК)
NM_001430
NM_010137
RefSeq (білок)
NP_001421
NP_034267
Локус (UCSC) Хр. 2: 46.29 – 46.39 Mb Хр. 17: 87.06 – 87.14 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EPAS1 (англ. Endothelial PAS domain protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 870 амінокислот, а молекулярна маса — 96 459[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MTADKEKKRS SSERRKEKSR DAARCRRSKE TEVFYELAHE LPLPHSVSSH
LDKASIMRLA ISFLRTHKLL SSVCSENESE AEADQQMDNL YLKALEGFIA
VVTQDGDMIF LSENISKFMG LTQVELTGHS IFDFTHPCDH EEIRENLSLK
NGSGFGKKSK DMSTERDFFM RMKCTVTNRG RTVNLKSATW KVLHCTGQVK
VYNNCPPHNS LCGYKEPLLS CLIIMCEPIQ HPSHMDIPLD SKTFLSRHSM
DMKFTYCDDR ITELIGYHPE ELLGRSAYEF YHALDSENMT KSHQNLCTKG
QVVSGQYRML AKHGGYVWLE TQGTVIYNPR NLQPQCIMCV NYVLSEIEKN
DVVFSMDQTE SLFKPHLMAM NSIFDSSGKG AVSEKSNFLF TKLKEEPEEL
AQLAPTPGDA IISLDFGNQN FEESSAYGKA ILPPSQPWAT ELRSHSTQSE
AGSLPAFTVP QAAAPGSTTP SATSSSSSCS TPNSPEDYYT SLDNDLKIEV
IEKLFAMDTE AKDQCSTQTD FNELDLETLA PYIPMDGEDF QLSPICPEER
LLAENPQSTP QHCFSAMTNI FQPLAPVAPH SPFLLDKFQQ QLESKKTEPE
HRPMSSIFFD AGSKASLPPC CGQASTPLSS MGGRSNTQWP PDPPLHFGPT
KWAVGDQRTE FLGAAPLGPP VSPPHVSTFK TRSAKGFGAR GPDVLSPAMV
ALSNKLKLKR QLEYEEQAFQ DLSGGDPPGG STSHLMWKRM KNLRGGSCPL
MPDKPLSANV PNDKFTQNPM RGLGHPLRHL PLPQPPSAIS PGENSKSRFP
PQCYATQYQD YSLSSAHKVS GMASRLLGPS FESYLLPELT RYDCEVNVPV
LGSSTLLQGG DLLRALDQAT

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ангіогенез, диференціація, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Tian H., McKnight S.L., Russell D.W. (1997). Endothelial PAS domain protein 1 (EPAS1), a transcription factor selectively expressed in endothelial cells. Genes Dev. 11: 72—82. PMID 9000051 doi:10.1101/gad.11.1.72
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

Див. також