ERV3-1 (англ. Endogenous retrovirus group 3 member 1, envelope) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 604 амінокислот, а молекулярна маса — 67 942[3].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MLGMNMLLIT
|
|
LFLLLPLSML
|
|
KGEPWEGCLH
|
|
CTHTTWSGNI
|
|
MTKTLLYHTY
|
| YECAGTCLGT
|
|
CTHNQTTYSV
|
|
CDPGRGQPYV
|
|
CYDPKSSPGT
|
|
WFEIHVGSKE
|
| GDLLNQTKVF
|
|
PSGKDVVSLY
|
|
FDVCQIVSMG
|
|
SLFPVIFSSM
|
|
EYYSSCHKNR
|
| YAHPACSTDS
|
|
PVTTCWDCTT
|
|
WSTNQQSLGP
|
|
IMLTKIPLEP
|
|
DCKTSTCNSV
|
| NLTILEPDQP
|
|
IWTTGLKAPL
|
|
GARVSGEEIG
|
|
PGAYVYLYII
|
|
KKTRTRSTQQ
|
| FRVFESFYEH
|
|
VNQKLPEPPP
|
|
LASNLFAQLA
|
|
ENIASSLHVA
|
|
SCYVCGGMNM
|
| GDQWPWEARE
|
|
LMPQDNFTLT
|
|
ASSLEPAPSS
|
|
QSIWFLKTSI
|
|
IGKFCIARWG
|
| KAFTDPVGEL
|
|
TCLGQQYYNE
|
|
TLGKTLWRGK
|
|
SNNSESPHPS
|
|
PFSRFPSLNH
|
| SWYQLEAPNT
|
|
WQAPSGLYWI
|
|
CGPQAYRQLP
|
|
AKWSGACVLG
|
|
TIRPSFFLMP
|
| LKQGEALGYP
|
|
IYDETKRKSK
|
|
RGITIGDWKD
|
|
NEWPPERIIQ
|
|
YYGPATWAED
|
| GMWGYRTPVY
|
|
MLNRIIRLQA
|
|
VLEIITNETA
|
|
GALNLLAQQA
|
|
TKMRNVIYQN
|
| RLALDYLLAQ
|
|
EEGVCGKFNL
|
|
TNCCLELDDE
|
|
GKVIKEITAK
|
|
IQKLAHIPVQ
|
| TWKG
|
Література
- Cohen M., Powers M., O'Connell C., Kato N. (1985). The nucleotide sequence of the env gene from the human provirus ERV3 and isolation and characterization of an ERV3-specific cDNA. Virology. 147: 449—458. PMID 3840930 doi:10.1016/0042-6822(85)90147-3
- Venables P.J.W., Brookes S.M., Griffiths D., Weiss R.A., Boyd M.T. (1995). Abundance of an endogenous retroviral envelope protein in placental trophoblasts suggests a biological function. Virology. 211: 589—592. PMID 7645262 doi:10.1006/viro.1995.1442
- Lin L., Xu B., Rote N.S. (2000). The cellular mechanism by which the human endogenous retrovirus ERV-3 env gene affects proliferation and differentiation in a human placental trophoblast model, BeWo. Placenta. 21: 73—78. PMID 10692254 doi:10.1053/plac.1999.0443
- Blaise S., de Parseval N., Benit L., Heidmann T. (2003). Genomewide screening for fusogenic human endogenous retrovirus envelopes identifies syncytin 2, a gene conserved on primate evolution. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 13013—13018. PMID 14557543 doi:10.1073/pnas.2132646100
- de Parseval N., Lazar V., Casella J.-F., Benit L., Heidmann T. (2003). Survey of human genes of retroviral origin: identification and transcriptome of the genes with coding capacity for complete envelope proteins. J. Virol. 77: 10414—10422. PMID 12970426 doi:10.1128/JVI.77.19.10414-10422.2003
- Rasmussen H.B., Clausen J. (1998). Large number of polymorphic nucleotides and a termination codon in the env gene of the endogenous human retrovirus ERV3. Dis. Markers. 14: 127—133. PMID 10427470 doi:10.1155/1998/958379
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|