| ESR2
|
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
| Список кодів PDB |
|
4J26, 1L2J, 1NDE, 1QKM, 1U3Q, 1U3R, 1U3S, 1U9E, 1X76, 1X78, 1X7B, 1X7J, 1YY4, 1YYE, 1ZAF, 2FSZ, 2GIU, 2I0G, 2JJ3, 2NV7, 2QTU, 2YJD, 2YLY, 2Z4B, 3OLL, 3OLS, 3OMO, 3OMP, 3OMQ, 4J24, 4ZI1
| | |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ESR2, ER-BETA, ESR-BETA, ESRB, ESTRB, Erb, NR3A2, estrogen receptor 2, ODG8 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601663 MGI: 109392 HomoloGene: 1100 GeneCards: ESR2
|
|---|
|
|
| Реагує на сполуку |
|---|
| Естрадіол, діетилстільбестрол, estriol, estrone, ethinylestradiol, Геністейн, тамоксифен, бісфенол А, lasofoxifene, bazedoxifene, C₂₈H₂₇NO₄S, fosfestrol, acolbifene, erteberel, estramustine phosphate sodium, droloxifene[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • зв’язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • steroid binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • receptor antagonist activity • lipid binding • enzyme binding • estrogen response element binding • core promoter sequence-specific DNA binding • estrogen receptor activity • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• мітохондрія • клітинне ядро • нуклеоплазма • extracellular region
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of cell growth • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • cell-cell signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • extracellular negative regulation of signal transduction • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • intracellular estrogen receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to estradiol stimulus • negative regulation of signaling receptor activity
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 14: 64.08 – 64.34 Mb
| Хр. 12: 76.17 – 76.22 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
ESR2 (англ. Estrogen receptor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 530 амінокислот, а молекулярна маса — 59 216[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDIKNSPSSL
|
|
NSPSSYNCSQ
|
|
SILPLEHGSI
|
|
YIPSSYVDSH
|
|
HEYPAMTFYS
|
| PAVMNYSIPS
|
|
NVTNLEGGPG
|
|
RQTTSPNVLW
|
|
PTPGHLSPLV
|
|
VHRQLSHLYA
|
| EPQKSPWCEA
|
|
RSLEHTLPVN
|
|
RETLKRKVSG
|
|
NRCASPVTGP
|
|
GSKRDAHFCA
|
| VCSDYASGYH
|
|
YGVWSCEGCK
|
|
AFFKRSIQGH
|
|
NDYICPATNQ
|
|
CTIDKNRRKS
|
| CQACRLRKCY
|
|
EVGMVKCGSR
|
|
RERCGYRLVR
|
|
RQRSADEQLH
|
|
CAGKAKRSGG
|
| HAPRVRELLL
|
|
DALSPEQLVL
|
|
TLLEAEPPHV
|
|
LISRPSAPFT
|
|
EASMMMSLTK
|
| LADKELVHMI
|
|
SWAKKIPGFV
|
|
ELSLFDQVRL
|
|
LESCWMEVLM
|
|
MGLMWRSIDH
|
| PGKLIFAPDL
|
|
VLDRDEGKCV
|
|
EGILEIFDML
|
|
LATTSRFREL
|
|
KLQHKEYLCV
|
| KAMILLNSSM
|
|
YPLVTATQDA
|
|
DSSRKLAHLL
|
|
NAVTDALVWV
|
|
IAKSGISSQQ
|
| QSMRLANLLM
|
|
LLSHVRHASN
|
|
KGMEHLLNMK
|
|
CKNVVPVYDL
|
|
LLEMLNAHVL
|
| RGCKSSITGS
|
|
ECSPAEDSKS
|
|
KEGSQNPQSQ
|
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку, ДНК, стероїдами.
Локалізований у ядрі.
Література
- Lee, E.B.; Chakravarthi, V.P.; Wolfe, M.W.; Rumi, M.A.K. ERβ Regulation of Gonadotropin Responses during Folliculogenesis. Int. J. Mol. Sci. 2021, 22, 10348. https://doi.org/10.3390/ijms221910348 (англ.)
- Leung Y.K., Mak P., Hassan S., Ho S.M. (2006). Estrogen receptor (ER)-beta isoforms: a key to understanding ER-beta signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 13162—13167. PMID 16938840 doi:10.1073/pnas.0605676103
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Li L.C., Yeh C.C., Nojima D., Dahiya R. (2000). Cloning and characterization of human estrogen receptor beta promoter. Biochem. Biophys. Res. Commun. 275: 682—689. PMID 10964723 doi:10.1006/bbrc.2000.3363
- Mosselman S., Polman J., Dijkema R. (1996). ER beta: identification and characterization of a novel human estrogen receptor. FEBS Lett. 392: 49—53. PMID 8769313 doi:10.1016/0014-5793(96)00782-X
- Pace P., Taylor J., Suntharalingam S., Coombes R.C., Ali S. (1997). Human estrogen receptor beta binds DNA in a manner similar to and dimerizes with estrogen receptor alpha. J. Biol. Chem. 272: 25832—25838. PMID 9325313 doi:10.1074/jbc.272.41.25832
- Caira F., Antonson P., Pelto-Huikko M., Treuter E., Gustafsson J.-A. (2000). Cloning and characterization of RAP250, a nuclear receptor coactivator. J. Biol. Chem. 275: 5308—5317. PMID 10681503 doi:10.1074/jbc.275.8.5308
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|