| JDP2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| JDP2, JUNDM2, Jun dimerization protein 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 608657 MGI: 1932093 HomoloGene: 12787 GeneCards: JDP2
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| ожиріння[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування дволанцюгових ДНК • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001106 transcription corepressor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• positive regulation of histone deacetylation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of fat cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of histone deacetylation • transcription, DNA-templated
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 14: 75.43 – 75.47 Mb
| Хр. 12: 85.65 – 85.69 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
JDP2 (англ. Jun dimerization protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 163 амінокислот, а молекулярна маса — 18 704[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MMPGQIPDPS
|
|
VTTGSLPGLG
|
|
PLTGLPSSAL
|
|
TVEELKYADI
|
|
RNLGAMIAPL
|
| HFLEVKLGKR
|
|
PQPVKSELDE
|
|
EEERRKRRRE
|
|
KNKVAAARCR
|
|
NKKKERTEFL
|
| QRESERLELM
|
|
NAELKTQIEE
|
|
LKQERQQLIL
|
|
MLNRHRPTCI
|
|
VRTDSVKTPE
|
| SEGNPLLEQL
|
|
EKK
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Murata T., Shinozuka Y., Obata Y., Yokoyama K.K. (2008). Phosphorylation of two eukaryotic transcription factors, Jun dimerization protein 2 and activation transcription factor 2, in Escherichia coli by Jun N-terminal kinase 1. Anal. Biochem. 376: 115—121. PMID 18307971 doi:10.1016/j.ab.2008.01.038
- Kimura M. (2008). IRF2-binding protein-1 is a JDP2 ubiquitin ligase and an inhibitor of ATF2-dependent transcription. FEBS Lett. 582: 2833—2837. PMID 18671972 doi:10.1016/j.febslet.2008.07.033
- Jin C., Li H., Ugai H., Murata T., Yokoyama K.K. (2002). Transcriptional regulation of the c-jun gene by AP-1 repressor protein JDP2 during the differentiation of F9 cells. Nucleic Acids Res. Suppl. 2: 97—98. PMID 12903123
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|