| FOXG1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| FOXG1, BF1, BF2, FHKL3, FKH2, FKHL1, FKHL2, FKHL3, FKHL4, FOXG1A, FOXG1B, FOXG1C, HBF-1, HBF-2, HBF-3, HBF-G2, HBF2, HFK1, HFK2, HFK3, KHL2, QIN, forkhead box G1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 164874 MGI: 1347464 HomoloGene: 3843 GeneCards: FOXG1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| синдром Ретта[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• multicellular organism development • GO:0010260 старіння людини • brain development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of neuroblast proliferation • regulation of mitotic cell cycle • dorsal/ventral pattern formation • регуляція експресії генів • axon midline choice point recognition • pyramidal neuron migration to cerebral cortex • central nervous system neuron development • cerebral cortex development • Нейрогенез • forebrain development • inner ear morphogenesis • negative regulation of neuron differentiation • positive regulation of neuron differentiation • positive regulation of cell cycle • neuron fate determination • cell morphogenesis involved in neuron differentiation • regulation of cell cycle • regulation of neural precursor cell proliferation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 14: 28.77 – 28.77 Mb
| Хр. 12: 49.43 – 49.43 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
FOXG1 (англ. Forkhead box G1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 489 амінокислот, а молекулярна маса — 52 352[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MLDMGDRKEV
|
|
KMIPKSSFSI
|
|
NSLVPEAVQN
|
|
DNHHASHGHH
|
|
NSHHPQHHHH
|
| HHHHHHHPPP
|
|
PAPQPPPPPQ
|
|
QQQPPPPPPP
|
|
APQPPQTRGA
|
|
PAADDDKGPQ
|
| QLLLPPPPPP
|
|
PPAAALDGAK
|
|
ADGLGGKGEP
|
|
GGGPGELAPV
|
|
GPDEKEKGAG
|
| AGGEEKKGAG
|
|
EGGKDGEGGK
|
|
EGEKKNGKYE
|
|
KPPFSYNALI
|
|
MMAIRQSPEK
|
| RLTLNGIYEF
|
|
IMKNFPYYRE
|
|
NKQGWQNSIR
|
|
HNLSLNKCFV
|
|
KVPRHYDDPG
|
| KGNYWMLDPS
|
|
SDDVFIGGTT
|
|
GKLRRRSTTS
|
|
RAKLAFKRGA
|
|
RLTSTGLTFM
|
| DRAGSLYWPM
|
|
SPFLSLHHPR
|
|
ASSTLSYNGT
|
|
TSAYPSHPMP
|
|
YSSVLTQNSL
|
| GNNHSFSTAN
|
|
GLSVDRLVNG
|
|
EIPYATHHLT
|
|
AAALAASVPC
|
|
GLSVPCSGTY
|
| SLNPCSVNLL
|
|
AGQTSYFFPH
|
|
VPHPSMTSQS
|
|
STSMSARAAS
|
|
SSTSPQAPST
|
| LPCESLRPSL
|
|
PSFTTGLSGG
|
|
LSDYFTHQNQ
|
|
GSSSNPLIH
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Bredenkamp N., Seoighe C., Illing N. (2007). Comparative evolutionary analysis of the FoxG1 transcription factor from diverse vertebrates identifies conserved recognition sites for microRNA regulation. Dev. Genes Evol. 217: 227—233. PMID 17260156 doi:10.1007/s00427-006-0128-x
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|