| KLF13
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| KLF13, BTEB3, FKLF2, NSLP1, RFLAT-1, RFLAT1, Kruppel-like factor 13, Kruppel like factor 13 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 605328 MGI: 1354948 HomoloGene: 32288 GeneCards: KLF13
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of erythrocyte differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 15: 31.33 – 31.44 Mb
| Хр. 7: 63.54 – 63.59 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
KLF13 (англ. Kruppel like factor 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 288 амінокислот, а молекулярна маса — 31 180[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAAAAYVDHF
|
|
AAECLVSMSS
|
|
RAVVHGPREG
|
|
PESRPEGAAV
|
|
AATPTLPRVE
|
| ERRDGKDSAS
|
|
LFVVARILAD
|
|
LNQQAPAPAP
|
|
AERREGAAAR
|
|
KARTPCRLPP
|
| PAPEPTSPGA
|
|
EGAAAAPPSP
|
|
AWSEPEPEAG
|
|
LEPEREPGPA
|
|
GSGEPGLRQR
|
| VRRGRSRADL
|
|
ESPQRKHKCH
|
|
YAGCEKVYGK
|
|
SSHLKAHLRT
|
|
HTGERPFACS
|
| WQDCNKKFAR
|
|
SDELARHYRT
|
|
HTGEKKFSCP
|
|
ICEKRFMRSD
|
|
HLTKHARRHA
|
| NFHPGMLQRR
|
|
GGGSRTGSLS
|
|
DYSRSDASSP
|
|
TISPASSP
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Song A., Chen Y.F., Thamatrakoln K., Storm T.A., Krensky A.M. (1999). RFLAT-1: a new zinc finger transcription factor that activates RANTES gene expression in T lymphocytes. Immunity. 10: 93—103. PMID 10023774 doi:10.1016/S1074-7613(00)80010-2
- Cook T., Gebelein B., Urrutia R. (1999). Sp1 and its likes: biochemical and functional predictions for a growing family of zinc finger transcription factors. Ann. N. Y. Acad. Sci. 880: 94—102. PMID 10415854 doi:10.1111/j.1749-6632.1999.tb09513.x
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|