| PITX1
|
|---|
 |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| PITX1, BFT, CCF, LBNBG, POTX, PTX1, paired like homeodomain 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602149 MGI: 107374 HomoloGene: 20584 GeneCards: PITX1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Клишоногість, Liebenberg syndrome[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • transcription regulator complex • ядерце • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• skeletal system development • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • anatomical structure morphogenesis • transcription by RNA polymerase II • hindlimb morphogenesis • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • cartilage development • myoblast fate commitment • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • branchiomeric skeletal muscle development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic hindlimb morphogenesis
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 5: 135.03 – 135.03 Mb
| Хр. 13: 55.97 – 55.98 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
PITX1 (англ. Paired like homeodomain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 34 128[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDAFKGGMSL
|
|
ERLPEGLRPP
|
|
PPPPHDMGPA
|
|
FHLARPADPR
|
|
EPLENSASES
|
| SDTELPEKER
|
|
GGEPKGPEDS
|
|
GAGGTGCGGA
|
|
DDPAKKKKQR
|
|
RQRTHFTSQQ
|
| LQELEATFQR
|
|
NRYPDMSMRE
|
|
EIAVWTNLTE
|
|
PRVRVWFKNR
|
|
RAKWRKRERN
|
| QQLDLCKGGY
|
|
VPQFSGLVQP
|
|
YEDVYAAGYS
|
|
YNNWAAKSLA
|
|
PAPLSTKSFT
|
| FFNSMSPLSS
|
|
QSMFSAPSSI
|
|
SSMTMPSSMG
|
|
PGAVPGMPNS
|
|
GLNNINNLTG
|
| SSLNSAMSPG
|
|
ACPYGTPASP
|
|
YSVYRDTCNS
|
|
SLASLRLKSK
|
|
QHSSFGYGGL
|
| QGPASGLNAC
|
|
QYNS
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Shang J., Li X., Ring H.Z., Clayton D.A., Francke U. (1997). Backfoot, a novel homeobox gene, maps to human chromosome 5 (BFT) and mouse chromosome 13 (Bft). Genomics. 40: 108—113. PMID 9070926 doi:10.1006/geno.1996.4558
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|