GTF2F2

GTF2F2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BBY, 1F3U, 2BBY, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	GTF2F2, BTF4, RAP30, TF2F2, TFIIF, general transcription factor IIF subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 189969 MGI: 1915955 HomoloGene: 37884 GeneCards: GTF2F2
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • nucleotide binding; • GO:0008026 helicase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • ATP binding;
Клітинна компонента	• microtubule cytoskeleton; • нуклеоплазма; • transcription factor TFIIF complex; • клітинне ядро; • transcription preinitiation complex;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of viral transcription; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • RNA metabolic process; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2963
	68705
	ENSG00000188342
	ENSMUSG00000067995
	P13984
	Q8R0A0
	NM_004128
	NM_026816
	NP_004119
	NP_081092
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GTF2F2 (англ. General transcription factor IIF subunit 2) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 249 амінокислот, а молекулярна маса — 28 380^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAERGELDLT	GAKQNTGVWL	VKVPKYLSQQ	WAKASGRGEV	GKLRIAKTQG
RTEVSFTLNE	DLANIHDIGG	KPASVSAPRE	HPFVLQSVGG	QTLTVFTESS
SDKLSLEGIV	VQRAECRPAA	SENYMRLKRL	QIEESSKPVR	LSQQLDKVVT
TNYKPVANHQ	YNIEYERKKK	EDGKRARADK	QHVLDMLFSA	FEKHQYYNLK
DLVDITKQPV	VYLKEILKEI	GVQNVKGIHK	NTWELKPEYR	HYQGEEKSD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Sopta M., Burton Z.F., Greenblatt J. (1989). Structure and associated DNA-helicase activity of a general transcription initiation factor that binds to RNA polymerase II. Nature. 341: 410—414. PMID 2477704 doi:10.1038/341410a0
Horikoshi M., Fujita H., Wang J., Takada R., Roeder R.G. (1991). Nucleotide and amino acid sequence of RAP30. Nucleic Acids Res. 19: 5436—5436. PMID 1840667 doi:10.1093/nar/19.19.5436
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Kim J.B., Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp P.A. (1999). Tat-SF1 protein associates with RAP30 and human SPT5 proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 5960—5968. PMID 10454543 doi:10.1128/MCB.19.9.5960
Groft C.M., Uljon S.N., Wang R., Werner M.H. (1998). Structural homology between the Rap30 DNA-binding domain and linker histone H5: implications for preinitiation complex assembly. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 9117—9122. PMID 9689043 doi:10.1073/pnas.95.16.9117

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з General transcription factor IIF subunit 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4653 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P13984 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 13

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з General transcription factor IIF subunit 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4653 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P13984 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]