ATF5

ATF5
Ідентифікатори
Символи	ATF5, ATFX, HMFN0395, activating transcription factor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 606398 MGI: 2141857 HomoloGene: 32142 GeneCards: ATF5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • chromatin binding; • tubulin binding; • kinase binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• центросома; • transcription regulator complex; • нуклеоплазма; • центр організації мікротрубочок; • цитоскелет; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• negative regulation of cell cycle G2/M phase transition; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • olfactory bulb interneuron differentiation; • multicellular organism growth; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of apoptotic process; • Післязародковий розвиток; • transcription, DNA-templated; • cerebellar granule cell precursor proliferation; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • regulation of centrosome cycle; • циркадний ритм; • olfactory bulb interneuron development; • регуляція експресії генів; • olfactory lobe development; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • fat cell differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of cell population proliferation; • transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	22809
	107503
	ENSG00000169136
	ENSMUSG00000038539
	Q9Y2D1
	O70191
	NM_001193646; NM_001290746; NM_012068
	NM_030693
	NP_001180575; NP_001277675; NP_036200
	NP_109618
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ATF5 (англ. Activating transcription factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 282 амінокислот, а молекулярна маса — 30 674^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLLATLGLE	LDRALLPASG	LGWLVDYGKL	PPAPAPLAPY	EVLGGALEGG
LPVGGEPLAG	DGFSDWMTER	VDFTALLPLE	PPLPPGTLPQ	PSPTPPDLEA
MASLLKKELE	QMEDFFLDAP	PLPPPSPPPL	PPPPLPPAPS	LPLSLPSFDL
PQPPVLDTLD	LLAIYCRNEA	GQEEVGMPPL	PPPQQPPPPS	PPQPSRLAPY
PHPATTRGDR	KQKKRDQNKS	AALRYRQRKR	AEGEALEGEC	QGLEARNREL
KERAESVERE	IQYVKDLLIE	VYKARSQRTR	SC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Pati D., Meistrich M.L., Plon S.E. (1999). Human Cdc34 and Rad6B ubiquitin-conjugating enzymes target repressors of cyclic AMP-induced transcription for proteolysis. Mol. Cell. Biol. 19: 5001—5013. PMID 10373550 doi:10.1128/MCB.19.7.5001
Pascual M., Gomez-Lechon M.J., Castell J.V., Jover R. (2008). ATF5 is a highly abundant liver-enriched transcription factor that cooperates with constitutive androstane receptor in the transactivation of CYP2B6: implications in hepatic stress responses. Drug Metab. Dispos. 36: 1063—1072. PMID 18332083 doi:10.1124/dmd.107.019380
Dluzen D., Li G., Tacelosky D., Moreau M., Liu D.X. (2011). BCL-2 is a downstream target of ATF5 that mediates the prosurvival function of ATF5 in a cell type-dependent manner. J. Biol. Chem. 286: 7705—7713. PMID 21212266 doi:10.1074/jbc.M110.207639
Liu D.X., Qian D., Wang B., Yang J.M., Lu Z. (2011). p300-Dependent ATF5 acetylation is essential for Egr-1 gene activation and cell proliferation and survival. Mol. Cell. Biol. 31: 3906—3916. PMID 21791614 doi:10.1128/MCB.05887-11

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:790 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y2D1 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:790 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9Y2D1 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]