| FIGLA
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| FIGLA, BHLHC8, FIGALPHA, POF6, folliculogenesis specific bHLH transcription factor |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 608697 MGI: 1349421 HomoloGene: 49294 GeneCards: FIGLA
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • protein dimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • transcription regulator complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• multicellular organism development • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • oocyte development • Оогенез
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 70.78 – 70.79 Mb
| Хр. 6: 85.99 – 86 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
FIGLA (англ. Folliculogenesis specific bHLH transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 219 амінокислот, а молекулярна маса — 24 123[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDPAPGVLDP
|
|
RAAPPALLGT
|
|
PQAEVLEDVL
|
|
REQFGPLPQL
|
|
AAVCRLKRLP
|
| SGGYSSTENL
|
|
QLVLERRRVA
|
|
NAKERERIKN
|
|
LNRGFARLKA
|
|
LVPFLPQSRK
|
| PSKVDILKGA
|
|
TEYIQVLSDL
|
|
LEGAKDSKKQ
|
|
DPDEQSYSNN
|
|
SSESHTSSAR
|
| QLSRNITQHI
|
|
SCAFGLKNEE
|
|
EGPWADGGSG
|
|
EPAHACRHSV
|
|
MSTTEIISPT
|
| RSLDRFPEVE
|
|
LLSHRLPQV
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Bayne R.A.L., Martins da Silva S.J., Anderson R.A. (2004). Increased expression of the FIGLA transcription factor is associated with primordial follicle formation in the human fetal ovary. Mol. Hum. Reprod. 10: 373—381. PMID 15044608 doi:10.1093/molehr/gah056
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|