| SP1
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| SP1, entrez:6667, Sp1 transcription factor |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 189906 MGI: 98372 HomoloGene: 8276 GeneCards: SP1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• protein homodimerization activity • HMG box domain binding • transcription factor binding • histone deacetylase binding • зв’язування з іоном металу • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • bHLH transcription factor binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • nucleic acid binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • зв’язування дволанцюгових ДНК • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • нуклеоплазма • protein-DNA complex • клітинне ядро • transcription repressor complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• positive regulation of hydrogen sulfide biosynthetic process • ритмічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0022415 viral process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II • cellular response to insulin stimulus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cholesterol biosynthetic process • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of vascular endothelial cell proliferation • response to hydroperoxide
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 12: 53.38 – 53.42 Mb
| Хр. 15: 102.31 – 102.34 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
SP1 (англ. Sp1 transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 785 амінокислот, а молекулярна маса — 80 693[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSDQDHSMDE
|
|
MTAVVKIEKG
|
|
VGGNNGGNGN
|
|
GGGAFSQARS
|
|
SSTGSSSSTG
|
| GGGQESQPSP
|
|
LALLAATCSR
|
|
IESPNENSNN
|
|
SQGPSQSGGT
|
|
GELDLTATQL
|
| SQGANGWQII
|
|
SSSSGATPTS
|
|
KEQSGSSTNG
|
|
SNGSESSKNR
|
|
TVSGGQYVVA
|
| AAPNLQNQQV
|
|
LTGLPGVMPN
|
|
IQYQVIPQFQ
|
|
TVDGQQLQFA
|
|
ATGAQVQQDG
|
| SGQIQIIPGA
|
|
NQQIITNRGS
|
|
GGNIIAAMPN
|
|
LLQQAVPLQG
|
|
LANNVLSGQT
|
| QYVTNVPVAL
|
|
NGNITLLPVN
|
|
SVSAATLTPS
|
|
SQAVTISSSG
|
|
SQESGSQPVT
|
| SGTTISSASL
|
|
VSSQASSSSF
|
|
FTNANSYSTT
|
|
TTTSNMGIMN
|
|
FTTSGSSGTN
|
| SQGQTPQRVS
|
|
GLQGSDALNI
|
|
QQNQTSGGSL
|
|
QAGQQKEGEQ
|
|
NQQTQQQQIL
|
| IQPQLVQGGQ
|
|
ALQALQAAPL
|
|
SGQTFTTQAI
|
|
SQETLQNLQL
|
|
QAVPNSGPII
|
| IRTPTVGPNG
|
|
QVSWQTLQLQ
|
|
NLQVQNPQAQ
|
|
TITLAPMQGV
|
|
SLGQTSSSNT
|
| TLTPIASAAS
|
|
IPAGTVTVNA
|
|
AQLSSMPGLQ
|
|
TINLSALGTS
|
|
GIQVHPIQGL
|
| PLAIANAPGD
|
|
HGAQLGLHGA
|
|
GGDGIHDDTA
|
|
GGEEGENSPD
|
|
AQPQAGRRTR
|
| REACTCPYCK
|
|
DSEGRGSGDP
|
|
GKKKQHICHI
|
|
QGCGKVYGKT
|
|
SHLRAHLRWH
|
| TGERPFMCTW
|
|
SYCGKRFTRS
|
|
DELQRHKRTH
|
|
TGEKKFACPE
|
|
CPKRFMRSDH
|
| LSKHIKTHQN
|
|
KKGGPGVALS
|
|
VGTLPLDSGA
|
|
GSEGSGTATP
|
|
SALITTNMVA
|
| MEAICPEGIA
|
|
RLANSGINVM
|
|
QVADLQSINI
|
|
SGNGF
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Takahara T., Kanazu S., Yanagisawa S., Akanuma H. (2000). Heterogeneous Sp1 mRNAs in human HepG2 cells include a product of homotypic trans-splicing. J. Biol. Chem. 275: 38067—38072. PMID 10973950 doi:10.1074/jbc.M002010200
- Kadonaga J.T., Carner K.R., Masiarz F.R., Tjian R. (1987). Isolation of cDNA encoding transcription factor Sp1 and functional analysis of the DNA binding domain. Cell. 51: 1079—1090. PMID 3319186 doi:10.1016/0092-8674(87)90594-0
- Jackson S.P., Tjian R. (1988). O-glycosylation of eukaryotic transcription factors: implications for mechanisms of transcriptional regulation. Cell. 55: 125—133. PMID 3139301 doi:10.1016/0092-8674(88)90015-3
- Courey A.J., Tjian R. (1988). Analysis of Sp1 in vivo reveals multiple transcriptional domains, including a novel glutamine-rich activation motif. Cell. 55: 887—898. PMID 3142690 doi:10.1016/0092-8674(88)90144-4
- Wang L., Mukherjee S., Jia F., Narayan O., Zhao L.J. (1995). Interaction of virion protein Vpr of human immunodeficiency virus type 1 with cellular transcription factor Sp1 and trans-activation of viral long terminal repeat. J. Biol. Chem. 270: 25564—25569. PMID 7592727 doi:10.1074/jbc.270.43.25564
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|