SATB2

SATB2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WI3, 1WIZ, 2CSF
Ідентифікатори
Символи	SATB2, GLSS, SATB homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608148 MGI: 2679336 HomoloGene: 32249 GeneCards: SATB2
Пов'язані генетичні захворювання
неспецифічний виразковий коліт, isolated cleft palate, chromosome 2q32-q33 deletion syndrome[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • histone deacetylase complex • transcription regulator complex • nuclear matrix • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain • embryonic skeletal system morphogenesis • cellular response to organic substance • ремоделювання хроматину • roof of mouth development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • embryonic pattern specification • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron migration • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • cartilage development • регуляція експресії генів • osteoblast development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23314	212712
Ensembl	ENSG00000119042	ENSMUSG00000038331
UniProt	Q9UPW6	Q8VI24
RefSeq (мРНК)	NM_001172509 NM_001172517 NM_015265	NM_139146 NM_001358580 NM_001358581
RefSeq (білок)	NP_001165980 NP_001165988 NP_056080	NP_631885 NP_001345509 NP_001345510
Локус (UCSC)	Хр. 2: 199.27 – 199.47 Mb	Хр. 1: 56.83 – 57.02 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SATB2 (англ. SATB homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 733 амінокислот, а молекулярна маса — 82 555^[5].

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

• Хромосома 2