TAF4

TAF4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1H3O, 2P6V
Ідентифікатори
Символи	TAF4, TAF2C, TAF2C1, TAF4A, TAFII130, TAFII135, TATA-box binding protein associated factor 4, TAFII-135, TAFII-130, TAF(II)135, TAF(II)130
Зовнішні ІД	OMIM: 601796 MGI: 2152346 HomoloGene: 55723 GeneCards: TAF4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • aryl hydrocarbon receptor binding; • transcription factor binding; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity;
Клітинна компонента	• transcription factor TFTC complex; • transcription factor TFIID complex; • нуклеоплазма; • MLL1 complex; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • DNA-templated transcription, initiation; • ovarian follicle development; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • GO:0022415 viral process; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • RNA polymerase II preinitiation complex assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6874
	228980
	ENSG00000130699
	ENSMUSG00000039117
	O00268
	E9QAP7
	NM_003185
	NM_001081092
	NP_003176
	NP_001074561
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TAF4 (англ. TATA-box binding protein associated factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 085 амінокислот, а молекулярна маса — 110 114^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAGSDLLDE	VFFNSEVDEK	VVSDLVGSLE	SQLAASAAHH	HHLAPRTPEV
RAAAAGALGN	HVVSGSPAGA	AGAGPAAPAE	GAPGAAPEPP	PAGRARPGGG
GPQRPGPPSP	RRPLVPAGPA	PPAAKLRPPP	EGSAGSCAPV	PAAAAVAAGP
EPAPAGPAKP	AGPAALAARA	GPGPGPGPGP	GPGPGPGKPA	GPGAAQTLNG
SAALLNSHHA	AAPAVSLVNN	GPAALLPLPK	PAAPGTVIQT	PPFVGAAAPP
APAAPSPPAA	PAPAAPAAAP	PPPPPAPATL	ARPPGHPAGP	PTAAPAVPPP
AAAQNGGSAG	AAPAPAPAAG	GPAGVSGQPG	PGAAAAAPAP	GVKAESPKRV
VQAAPPAAQT	LAASGPASTA	ASMVIGPTMQ	GALPSPAAVP	PPAPGTPTGL
PKGAAGAVTQ	SLSRTPTATT	SGIRATLTPT	VLAPRLPQPP	QNPTNIQNFQ
LPPGMVLVRS	ENGQLLMIPQ	QALAQMQAQA	HAQPQTTMAP	RPATPTSAPP
VQISTVQAPG	TPIIARQVTP	TTIIKQVSQA	QTTVQPSATL	QRSPGVQPQL
VLGGAAQTAS	LGTATAVQTG	TPQRTVPGAT	TTSSAATETM	ENVKKCKNFL
STLIKLASSG	KQSTETAANV	KELVQNLLDG	KIEAEDFTSR	LYRELNSSPQ
PYLVPFLKRS	LPALRQLTPD	SAAFIQQSQQ	QPPPPTSQAT	TALTAVVLSS
SVQRTAGKTA	ATVTSALQPP	VLSLTQPTQV	GVGKQGQPTP	LVIQQPPKPG
ALIRPPQVTL	TQTPMVALRQ	PHNRIMLTTP	QQIQLNPLQP	VPVVKPAVLP
GTKALSAVSA	QAAAAQKNKL	KEPGGGSFRD	DDDINDVASM	AGVNLSEESA
RILATNSELV	GTLTRSCKDE	TFLLQAPLQR	RILEIGKKHG	ITELHPDVVS
YVSHATQQRL	QNLVEKISET	AQQKNFSYKD	DDRYEQASDV	RAQLKFFEQL
DQIEKQRKDE	QEREILMRAA	KSRSRQEDPE	QLRLKQKAKE	MQQQELAQMR
QRDANLTALA	AIGPRKKRKV	DCPGPGSGAE	GSGPGSVVPG	SSGVGTPRQF
TRQRITRVNL	RDLIFCLENE	RETSHSLLLY	KAFLK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

Mengus G., May M., Carre L., Chambon P., Davidson I. (1997). Human TAF(II)135 potentiates transcriptional activation by the AF-2s of the retinoic acid, vitamin D3, and thyroid hormone receptors in mammalian cells. Genes Dev. 11: 1381—1395. PMID 9192867 doi:10.1101/gad.11.11.1381
Tanese N., Saluja D., Vassallo M.F., Chen J.-L., Admon A. (1996). Molecular cloning and analysis of two subunits of the human TFIID complex: hTAFII130 and hTAFII100. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 13611—13616. PMID 8942982 doi:10.1073/pnas.93.24.13611
Damania B., Alwine J.C. (1996). TAF-like function of SV40 large T antigen. Genes Dev. 10: 1369—1381. PMID 8647434 doi:10.1101/gad.10.11.1369
Brand M., Yamamoto K., Staub A., Tora L. (1999). Identification of TATA-binding protein-free TAFII-containing complex subunits suggests a role in nucleosome acetylation and signal transduction. J. Biol. Chem. 274: 18285—18289. PMID 10373431 doi:10.1074/jbc.274.26.18285
Cavusoglu N., Brand M., Tora L., van Dorsselaer A. (2003). Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis. Proteomics. 3: 217—223. PMID 12601814 doi:10.1002/pmic.200390030

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11537 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O00268 (англ.) . Архів оригіналу за 23 січня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11537 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O00268 (англ.) . Архів оригіналу за 23 січня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]