| TFAP2D
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| TFAP2D, TFAP2BL1, transcription factor AP-2 delta, AP-2delta |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 610161 MGI: 2153466 HomoloGene: 17700 GeneCards: TFAP2D
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • transcription regulator complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cell population proliferation • inferior colliculus development • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1903374 anatomical structure development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 6: 50.71 – 50.77 Mb
| Хр. 1: 19.17 – 19.24 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
TFAP2D (англ. Transcription factor AP-2 delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 452 амінокислот, а молекулярна маса — 49 578[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSTTFPGLVH
|
|
DAEIRHDGSN
|
|
SYRLMQLGCL
|
|
ESVANSTVAY
|
|
SSSSPLTYST
|
| TGTEFASPYF
|
|
STNHQYTPLH
|
|
HQSFHYEFQH
|
|
SHPAVTPDAY
|
|
SLNSLHHSQQ
|
| YYQQIHHGEP
|
|
TDFINLHNAR
|
|
ALKSSCLDEQ
|
|
RRELGCLDAY
|
|
RRHDLSLMSH
|
| GSQYGMHPDQ
|
|
RLLPGPSLGL
|
|
AAAGADDLQG
|
|
SVEAQCGLVL
|
|
NGQGGVIRRG
|
| GTCVVNPTDL
|
|
FCSVPGRLSL
|
|
LSSTSKYKVT
|
|
IAEVKRRLSP
|
|
PECLNASLLG
|
| GILRRAKSKN
|
|
GGRCLREKLD
|
|
RLGLNLPAGR
|
|
RKAANVTLLT
|
|
SLVEGEALHL
|
| ARDFGYTCET
|
|
EFPAKAVGEH
|
|
LARQHMEQKE
|
|
QTARKKMILA
|
|
TKQICKEFQD
|
| LLSQDRSPLG
|
|
SSRPTPILDL
|
|
DIQRHLTHFS
|
|
LITHGFGTPA
|
|
ICAALSTFQT
|
| VLSEMLNYLE
|
|
KHTTHKNGGA
|
|
ADSGQGHANS
|
|
EKAPLRKTSE
|
|
AAVKEGKTEK
|
| TD
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|