| TFAP2A
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| TFAP2A, AP-2, AP-2alpha, AP2TF, BOFS, TFAP2, transcription factor AP-2 alpha |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 107580 MGI: 104671 HomoloGene: 2421 GeneCards: TFAP2A
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| бічний аміотрофічний склероз, branchiooculofacial syndrome[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• центросома • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• roof of mouth development • cellular response to iron ion • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • retina layer formation • розвиток нирки • positive regulation of bone mineralization • trigeminal nerve development • negative regulation of transcription by competitive promoter binding • optic vesicle morphogenesis • bone morphogenesis • negative regulation of apoptotic process • слух • eyelid development in camera-type eye • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of neuron apoptotic process • GO:1901313 positive regulation of gene expression • inner ear morphogenesis • optic cup structural organization • регуляція диференціювання клітин • embryonic cranial skeleton morphogenesis • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • embryonic forelimb morphogenesis • oculomotor nerve formation • negative regulation of cell population proliferation • positive regulation of tooth mineralization • transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of nucleic acid-templated transcription
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 6: 10.39 – 10.42 Mb
| Хр. 13: 40.87 – 40.89 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
TFAP2A (англ. Transcription factor AP-2 alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 437 амінокислот, а молекулярна маса — 48 062[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MLWKLTDNIK
|
|
YEDCEDRHDG
|
|
TSNGTARLPQ
|
|
LGTVGQSPYT
|
|
SAPPLSHTPN
|
| ADFQPPYFPP
|
|
PYQPIYPQSQ
|
|
DPYSHVNDPY
|
|
SLNPLHAQPQ
|
|
PQHPGWPGQR
|
| QSQESGLLHT
|
|
HRGLPHQLSG
|
|
LDPRRDYRRH
|
|
EDLLHGPHAL
|
|
SSGLGDLSIH
|
| SLPHAIEEVP
|
|
HVEDPGINIP
|
|
DQTVIKKGPV
|
|
SLSKSNSNAV
|
|
SAIPINKDNL
|
| FGGVVNPNEV
|
|
FCSVPGRLSL
|
|
LSSTSKYKVT
|
|
VAEVQRRLSP
|
|
PECLNASLLG
|
| GVLRRAKSKN
|
|
GGRSLREKLD
|
|
KIGLNLPAGR
|
|
RKAANVTLLT
|
|
SLVEGEAVHL
|
| ARDFGYVCET
|
|
EFPAKAVAEF
|
|
LNRQHSDPNE
|
|
QVTRKNMLLA
|
|
TKQICKEFTD
|
| LLAQDRSPLG
|
|
NSRPNPILEP
|
|
GIQSCLTHFN
|
|
LISHGFGSPA
|
|
VCAAVTALQN
|
| YLTEALKAMD
|
|
KMYLSNNPNS
|
|
HTDNNAKSSD
|
|
KEEKHRK
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Williams T., Admon A., Luescher B., Tjian R. (1988). Cloning and expression of AP-2, a cell-type-specific transcription factor that activates inducible enhancer elements. Genes Dev. 2: 1557—1569. PMID 3063603 doi:10.1101/gad.2.12a.1557
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Williams T., Tjian R. (1991). Characterization of a dimerization motif in AP-2 and its function in heterologous DNA-binding proteins. Science. 251: 1067—1071. PMID 1998122 doi:10.1126/science.1998122
- Williams T., Tjian R. (1991). Analysis of the DNA-binding and activation properties of the human transcription factor AP-2. Genes Dev. 5: 670—682. PMID 2010091 doi:10.1101/gad.5.4.670
- Garcia M.A., Campillos M., Marina A., Valdivieso F., Vazquez J. (1999). Transcription factor AP-2 activity is modulated by protein kinase A-mediated phosphorylation. FEBS Lett. 444: 27—31. PMID 10037142 doi:10.1016/S0014-5793(99)00021-6
- Eloranta J.J., Hurst H.C. (2002). Transcription factor AP-2 interacts with the SUMO-conjugating enzyme UBC9 and is sumolated in vivo. J. Biol. Chem. 277: 30798—30804. PMID 12072434 doi:10.1074/jbc.M202780200
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|