NR1D1

NR1D1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1A6Y, 1GA5, 1HLZ, 3N00
Ідентифікатори
Символи	NR1D1, EAR1, THRA1, THRAL, ear-1, hRev, nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, REVERBA, REVERBalpha
Зовнішні ІД	OMIM: 602408 MGI: 2444210 HomoloGene: 23324 GeneCards: NR1D1
Реагує на сполуку
	SR-9009, SR-9011
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • zinc ion binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • steroid hormone receptor activity; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • heme binding; • transcription corepressor binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • E-box binding; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • transcription factor binding; • nuclear receptor coactivator activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • cell projection; • dendritic spine; • нуклеоплазма; • дендрит (нейробіологія); • клітинне ядро; • ядерні тільця; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• диференціація клітин; • regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • ритмічний процес; • circadian temperature homeostasis; • positive regulation of bile acid biosynthetic process; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • circadian regulation of gene expression; • regulation of fat cell differentiation; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • regulation of lipid metabolic process; • glycogen biosynthetic process; • regulation of circadian rhythm; • циркадний ритм; • proteasomal protein catabolic process; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • response to leptin; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to lipopolysaccharide; • regulation of type B pancreatic cell proliferation; • negative regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway; • steroid hormone mediated signaling pathway; • intracellular receptor signaling pathway; • cholesterol homeostasis; • multicellular organism development; • hormone-mediated signaling pathway; • response to lipid; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of cold-induced thermogenesis; • protein destabilization; • regulation of circadian sleep/wake cycle; • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • negative regulation of inflammatory response; • negative regulation of astrocyte activation; • cellular response to interleukin-1; • cellular response to tumor necrosis factor; • negative regulation of neuroinflammatory response; • negative regulation of microglial cell activation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	9572
	217166
	ENSG00000126368
	ENSMUSG00000020889
	P20393
	Q3UV55
	NM_021724
	NM_145434
	NP_068370
	NP_663409
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NR1D1 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 614 амінокислот, а молекулярна маса — 66 805^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTTLDSNNNT	GGVITYIGSS	GSSPSRTSPE	SLYSDNSNGS	FQSLTQGCPT
YFPPSPTGSL	TQDPARSFGS	IPPSLSDDGS	PSSSSSSSSS	SSSFYNGSPP
GSLQVAMEDS	SRVSPSKSTS	NITKLNGMVL	LCKVCGDVAS	GFHYGVHACE
GCKGFFRRSI	QQNIQYKRCL	KNENCSIVRI	NRNRCQQCRF	KKCLSVGMSR
DAVRFGRIPK	REKQRMLAEM	QSAMNLANNQ	LSSQCPLETS	PTQHPTPGPM
GPSPPPAPVP	SPLVGFSQFP	QQLTPPRSPS	PEPTVEDVIS	QVARAHREIF
TYAHDKLGSS	PGNFNANHAS	GSPPATTPHR	WENQGCPPAP	NDNNTLAAQR
HNEALNGLRQ	APSSYPPTWP	PGPAHHSCHQ	SNSNGHRLCP	THVYAAPEGK
APANSPRQGN	SKNVLLACPM	NMYPHGRSGR	TVQEIWEDFS	MSFTPAVREV
VEFAKHIPGF	RDLSQHDQVT	LLKAGTFEVL	MVRFASLFNV	KDQTVMFLSR
TTYSLQELGA	MGMGDLLSAM	FDFSEKLNSL	ALTEEELGLF	TAVVLVSADR
SGMENSASVE	QLQETLLRAL	RALVLKNRPL	ETSRFTKLLL	KLPDLRTLNN
MHSEKLLSFR	VDAQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, диференціація клітин, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК, гемом. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних відростках.

Література

Lazar M.A., Jones K.E., Chin W.W. (1990). Isolation of a cDNA encoding human Rev-ErbA alpha: transcription from the noncoding DNA strand of a thyroid hormone receptor gene results in a related protein that does not bind thyroid hormone. DNA Cell Biol. 9: 77—83. PMID 1971514 doi:10.1089/dna.1990.9.77
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Coste H., Rodriguez J.C. (2002). Orphan nuclear hormone receptor Rev-erbalpha regulates the human apolipoprotein CIII promoter. J. Biol. Chem. 277: 27120—27129. PMID 12021280 doi:10.1074/jbc.M203421200
Yin L., Lazar M.A. (2005). The orphan nuclear receptor Rev-erbalpha recruits the N-CoR/histone deacetylase 3 corepressor to regulate the circadian Bmal1 gene. Mol. Endocrinol. 19: 1452—1459. PMID 15761026 doi:10.1210/me.2005-0057
Wang J., Yin L., Lazar M.A. (2006). The orphan nuclear receptor Rev-erb alpha regulates circadian expression of plasminogen activator inhibitor type 1. J. Biol. Chem. 281: 33842—33848. PMID 16968709 doi:10.1074/jbc.M607873200
Yin L., Wang J., Klein P.S., Lazar M.A. (2006). Nuclear receptor Rev-erbalpha is a critical lithium-sensitive component of the circadian clock. Science. 311: 1002—1005. PMID 16484495 doi:10.1126/science.1121613

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з nuclear receptor subfamily 1 group D member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7962 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P20393 (англ.) . Архів оригіналу за 4 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з nuclear receptor subfamily 1 group D member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7962 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P20393 (англ.) . Архів оригіналу за 4 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]