| DDIT3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| DDIT3, CEBPZ, CHOP, CHOP-10, CHOP10, GADD153, DNA damage-inducible transcript 3, DNA damage inducible transcript 3, C/EBPzeta, AltDDIT3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 126337 MGI: 109247 HomoloGene: 3012 GeneCards: DDIT3
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • cAMP response element binding protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • leucine zipper domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • гіалоплазма • late endosome • CHOP-C/EBP complex • нуклеоплазма • transcription factor AP-1 complex • protein-DNA complex • CHOP-ATF4 complex • CHOP-ATF3 complex • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0097285 апоптоз • release of sequestered calcium ion into cytosol • negative regulation of protein kinase B signaling • negative regulation of fat cell differentiation • negative regulation of myoblast differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • negative regulation of DNA binding • mRNA transcription by RNA polymerase II • positive regulation of neuron death • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Wnt • cell redox homeostasis • response to endoplasmic reticulum stress • PERK-mediated unfolded protein response • ER overload response • cellular response to DNA damage stimulus • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • ATF6-mediated unfolded protein response • positive regulation of neuron apoptotic process • response to unfolded protein • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress • negative regulation of RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding • positive regulation of interleukin-8 production • response to starvation • negative regulation of determination of dorsal identity • клітинний цикл • regulation of DNA-templated transcription in response to stress • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • blood vessel maturation • negative regulation of CREB transcription factor activity • Відповідь на незгорнуті білки • establishment of protein localization to mitochondrion • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to nitrosative stress • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • protein complex oligomerization • negative regulation of cold-induced thermogenesis • regulation of autophagy • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 12: 57.52 – 57.52 Mb
| Хр. 10: 127.13 – 127.13 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
DDIT3 (англ. DNA damage inducible transcript 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 169 амінокислот, а молекулярна маса — 19 175[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAAESLPFSF
|
|
GTLSSWELEA
|
|
WYEDLQEVLS
|
|
SDENGGTYVS
|
|
PPGNEEEESK
|
| IFTTLDPASL
|
|
AWLTEEEPEP
|
|
AEVTSTSQSP
|
|
HSPDSSQSSL
|
|
AQEEEEEDQG
|
| RTRKRKQSGH
|
|
SPARAGKQRM
|
|
KEKEQENERK
|
|
VAQLAEENER
|
|
LKQEIERLTR
|
| EVEATRRALI
|
|
DRMVNLHQA
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, відповідь на стрес, транскрипція, регуляція транскрипції, відповідь на порушення конформації білку, клітинний цикл, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Crozat A., Aman P., Mandahl N., Ron D. (1993). Fusion of CHOP to a novel RNA-binding protein in human myxoid liposarcoma. Nature. 363: 640—644. PMID 8510758 doi:10.1038/363640a0
- Rabbitts T.H., Forster A., Larson R., Nathan P. (1993). Fusion of the dominant negative transcription regulator CHOP with a novel gene FUS by translocation t(12;16) in malignant liposarcoma. Nat. Genet. 4: 175—180. PMID 7503811 doi:10.1038/ng0693-175
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Oyadomari S., Mori M. (2004). Roles of CHOP/GADD153 in endoplasmic reticulum stress. Cell Death Differ. 11: 381—389. PMID 14685163 doi:10.1038/sj.cdd.4401373
- Yamaguchi H., Wang H.G. (2004). CHOP is involved in endoplasmic reticulum stress-induced apoptosis by enhancing DR5 expression in human carcinoma cells. J. Biol. Chem. 279: 45495—45502. PMID 15322075 doi:10.1074/jbc.M406933200
- Ohoka N., Yoshii S., Hattori T., Onozaki K., Hayashi H. (2005). TRB3, a novel ER stress-inducible gene, is induced via ATF4-CHOP pathway and is involved in cell death. EMBO J. 24: 1243—1255. PMID 15775988 doi:10.1038/sj.emboj.7600596
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|